46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4870 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  100 
 
 		 1147 aa  2338    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1164 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  33.3 
 
 		 1101 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  29.62 
 
 		 958 aa  264  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  29.61 
 
 		 948 aa  262  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  33.22 
 
 		 714 aa  228  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  27.98 
 
 		 2038 aa  211  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  37.11 
 
 		 456 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1375 aa  191  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  29.72 
 
 		 2585 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  27.17 
 
 		 1037 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  29.43 
 
 		 2046 aa  166  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  29.63 
 
 		 2031 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  31.88 
 
 		 2113 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1209 aa  105  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1931 aa  97.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  26.27 
 
 		 2224 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  26.27 
 
 		 2224 aa  95.9  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  26.27 
 
 		 2224 aa  95.9  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.33 
 
 		 864 aa  94.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  30.35 
 
 		 508 aa  91.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.17 
 
 		 1064 aa  89.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  24.79 
 
 		 2225 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.61 
 
 		 2246 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  24.43 
 
 		 2178 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  27.05 
 
 		 2447 aa  82.4  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26.76 
 
 		 2221 aa  81.6  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  25.63 
 
 		 570 aa  80.9  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1367 aa  73.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.23 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  26.98 
 
 		 846 aa  66.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  27.5 
 
 		 2215 aa  58.9  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2370  hypothetical protein  30.38 
 
 		 216 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0389898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.11 
 
 		 3273 aa  53.5  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1576 aa  53.5  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  23.27 
 
 		 6678 aa  52.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  28.37 
 
 		 4357 aa  52.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0018  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1020 aa  50.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.68 
 
 		 11716 aa  50.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  26.7 
 
 		 739 aa  49.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2255  hypothetical protein  19.56 
 
 		 1374 aa  48.9  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  26.7 
 
 		 739 aa  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  21.87 
 
 		 1306 aa  45.8  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0562  hypothetical protein  28.23 
 
 		 391 aa  45.8  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  26.04 
 
 		 313 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  27.27 
 
 		 757 aa  44.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>