29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1053 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  100 
 
 		 948 aa  1933    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  91.14 
 
 		 958 aa  1713    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  32.13 
 
 		 1101 aa  345  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.61 
 
 		 1147 aa  277  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1164 aa  260  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  27.14 
 
 		 2038 aa  171  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1375 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  27.52 
 
 		 2585 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  34.13 
 
 		 2031 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  27.26 
 
 		 2046 aa  152  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  28.43 
 
 		 1037 aa  151  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1209 aa  141  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  32.5 
 
 		 508 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  26.8 
 
 		 2113 aa  95.1  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1931 aa  84.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  26.88 
 
 		 714 aa  73.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.5 
 
 		 864 aa  71.6  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.83 
 
 		 456 aa  70.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  28.02 
 
 		 2447 aa  65.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.91 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.47 
 
 		 1064 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  24.86 
 
 		 2225 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  23.42 
 
 		 2178 aa  52  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  24.93 
 
 		 570 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25 
 
 		 2246 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  23.37 
 
 		 2224 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  23.37 
 
 		 2224 aa  47.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  23.37 
 
 		 2224 aa  47.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26.67 
 
 		 2221 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>