31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1279 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  100 
 
 		 1037 aa  2077    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  33.38 
 
 		 1101 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  28.45 
 
 		 2038 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.96 
 
 		 1147 aa  185  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  29.8 
 
 		 2585 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1164 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  28.69 
 
 		 958 aa  158  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1209 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  28.13 
 
 		 948 aa  155  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  27.27 
 
 		 2031 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1375 aa  121  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 		 2046 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  25.75 
 
 		 2113 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1931 aa  88.6  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 3273 aa  58.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0562  hypothetical protein  32.69 
 
 		 391 aa  55.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8159  hypothetical protein  22.11 
 
 		 293 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  34.07 
 
 		 1490 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  23.29 
 
 		 539 aa  52.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  30.8 
 
 		 508 aa  51.2  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.97 
 
 		 959 aa  50.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  28.23 
 
 		 2221 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  27.24 
 
 		 456 aa  48.9  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  28.23 
 
 		 2246 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  28.78 
 
 		 658 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 		 571 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  26.46 
 
 		 685 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  34.46 
 
 		 456 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  28.1 
 
 		 2225 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  27.45 
 
 		 1308 aa  45.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.7 
 
 		 1154 aa  45.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>