93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3048 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  49.96 
 
 		 1303 aa  953    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  71 
 
 		 1736 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  42.03 
 
 		 1201 aa  752    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  52.36 
 
 		 1601 aa  1003    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  45.26 
 
 		 1430 aa  774    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  100 
 
 		 1308 aa  2647    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  56.87 
 
 		 1380 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  56.39 
 
 		 1363 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  55.9 
 
 		 1363 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  50.56 
 
 		 1272 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  51.19 
 
 		 1299 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  47.84 
 
 		 1299 aa  386  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  33.83 
 
 		 1973 aa  358  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  40.75 
 
 		 1247 aa  302  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  38.22 
 
 		 1248 aa  295  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  34.69 
 
 		 734 aa  175  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  39.52 
 
 		 760 aa  163  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.44 
 
 		 1154 aa  144  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  39.57 
 
 		 417 aa  140  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  37.44 
 
 		 409 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  39.45 
 
 		 3041 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  37.78 
 
 		 3193 aa  138  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  35.94 
 
 		 690 aa  132  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  41.01 
 
 		 828 aa  127  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  32.13 
 
 		 688 aa  125  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.06 
 
 		 1372 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  36.7 
 
 		 940 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  36.84 
 
 		 912 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  34.77 
 
 		 861 aa  121  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  32.39 
 
 		 470 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  26.69 
 
 		 1094 aa  102  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  28.35 
 
 		 539 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  27.64 
 
 		 506 aa  84  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  33.64 
 
 		 631 aa  82.4  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  25.86 
 
 		 840 aa  77  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  30.67 
 
 		 620 aa  73.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  24.93 
 
 		 625 aa  71.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  31.96 
 
 		 647 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  24.62 
 
 		 872 aa  70.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  33.33 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  30.53 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  26.16 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  30.67 
 
 		 625 aa  68.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  29.81 
 
 		 676 aa  66.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  28.16 
 
 		 779 aa  66.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  30.72 
 
 		 798 aa  65.1  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  46.81 
 
 		 603 aa  64.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  27.88 
 
 		 661 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  28.98 
 
 		 779 aa  64.3  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  26.88 
 
 		 523 aa  63.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  29.67 
 
 		 687 aa  63.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  29.63 
 
 		 708 aa  62.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.35 
 
 		 959 aa  62.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  27.11 
 
 		 647 aa  62.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  29.14 
 
 		 799 aa  59.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  29.14 
 
 		 798 aa  58.9  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  45 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4107  hypothetical protein  55.41 
 
 		 244 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  34.4 
 
 		 643 aa  54.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  32.58 
 
 		 1126 aa  55.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34.27 
 
 		 1019 aa  54.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.53 
 
 		 891 aa  53.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  48.28 
 
 		 442 aa  52.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.02 
 
 		 1113 aa  52.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  29.29 
 
 		 486 aa  52.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2137  hypothetical protein  46.58 
 
 		 308 aa  51.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.534217  normal  0.49056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.25 
 
 		 1225 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  46.15 
 
 		 626 aa  51.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  28.36 
 
 		 658 aa  50.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.96 
 
 		 536 aa  50.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.14 
 
 		 889 aa  50.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.64 
 
 		 1275 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.97 
 
 		 1340 aa  48.9  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  29.66 
 
 		 528 aa  48.5  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  25.17 
 
 		 569 aa  48.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  29.83 
 
 		 456 aa  48.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  23.44 
 
 		 470 aa  47.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  40.91 
 
 		 536 aa  47  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3758  hypothetical protein  46.03 
 
 		 1074 aa  47  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207079  normal  0.135364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  40.62 
 
 		 508 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.63 
 
 		 1118 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  23.44 
 
 		 470 aa  47.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  23.44 
 
 		 470 aa  47.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  23.44 
 
 		 470 aa  47.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  23.44 
 
 		 470 aa  47.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  23.44 
 
 		 470 aa  47.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  23.44 
 
 		 470 aa  47.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  23.44 
 
 		 470 aa  47.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.66 
 
 		 1222 aa  46.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  32.05 
 
 		 2762 aa  45.8  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  27.45 
 
 		 1037 aa  45.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  24.12 
 
 		 628 aa  45.1  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.38 
 
 		 1009 aa  45.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>