60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0982 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  100 
 
 		 470 aa  922    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  38.23 
 
 		 760 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.06 
 
 		 1154 aa  203  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  38.91 
 
 		 690 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  36.45 
 
 		 940 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  38.14 
 
 		 3041 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.77 
 
 		 1372 aa  173  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  36.3 
 
 		 3193 aa  172  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  36.93 
 
 		 912 aa  170  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  33.55 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  38.55 
 
 		 828 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  32.66 
 
 		 688 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  33.63 
 
 		 861 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3763  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  41.9 
 
 		 387 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  35.03 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  32.39 
 
 		 1308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  34.59 
 
 		 409 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  35.09 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  33.57 
 
 		 1126 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  32.58 
 
 		 1094 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  29.41 
 
 		 1019 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1289 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  31.23 
 
 		 974 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  29.37 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  29.76 
 
 		 883 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.65 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 		 959 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  30.51 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.47 
 
 		 1340 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.55 
 
 		 620 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.13 
 
 		 891 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.69 
 
 		 2194 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  29.17 
 
 		 1201 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.59 
 
 		 635 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 		 1225 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.17 
 
 		 1557 aa  50.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.7 
 
 		 1222 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  27.34 
 
 		 641 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.93 
 
 		 1113 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3417  esterase  30.18 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  26.86 
 
 		 604 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.72 
 
 		 714 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.98 
 
 		 1490 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.95 
 
 		 1012 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3988  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  36 
 
 		 601 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8159  hypothetical protein  29.88 
 
 		 293 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.43 
 
 		 889 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.91 
 
 		 1275 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  29.38 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  23.37 
 
 		 644 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  27.53 
 
 		 872 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  30.61 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  27.21 
 
 		 2059 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  27.21 
 
 		 2035 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.41 
 
 		 794 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  25.67 
 
 		 1346 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4255  FG-GAP repeat-containing protein  21.57 
 
 		 512 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000954182  hitchhiker  0.000000354896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  26.43 
 
 		 510 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.38 
 
 		 1009 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  26.84 
 
 		 514 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>