56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_2398 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 
417 aa  835    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  65.94 
 
 
409 aa  538  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  40 
 
 
1308 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.03 
 
 
1154 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  38.21 
 
 
760 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  34.91 
 
 
3193 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  34.98 
 
 
690 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  36.09 
 
 
912 aa  112  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  29.17 
 
 
688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  30.99 
 
 
828 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  35.09 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.64 
 
 
1372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  36.7 
 
 
3041 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  29.78 
 
 
861 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  32.89 
 
 
940 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  29.82 
 
 
506 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  34.08 
 
 
539 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.47 
 
 
1019 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 
620 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.76 
 
 
1126 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.35 
 
 
974 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.36 
 
 
1275 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.81 
 
 
1838 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.49 
 
 
1340 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.77 
 
 
1012 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  26.27 
 
 
604 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  29.25 
 
 
1517 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  28.16 
 
 
1328 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  25.48 
 
 
883 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  25.23 
 
 
1289 aa  53.5  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  24.4 
 
 
491 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.08 
 
 
872 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.64 
 
 
1222 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  27.27 
 
 
514 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.43 
 
 
1009 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.83 
 
 
2807 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.93 
 
 
1113 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  28.04 
 
 
1201 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  23.26 
 
 
780 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.32 
 
 
1490 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  25.75 
 
 
813 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  26.42 
 
 
534 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
621 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  29.52 
 
 
1094 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.92 
 
 
1118 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  25.33 
 
 
412 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.91 
 
 
3197 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.29 
 
 
959 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  25.62 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  23.19 
 
 
2497 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.15 
 
 
2194 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  30.05 
 
 
254 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.7 
 
 
1225 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  24.18 
 
 
1348 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  25.74 
 
 
752 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  24.81 
 
 
1437 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>