49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2985 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 620 aa  1261    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  37.74 
 
 		 883 aa  87.4  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  32.03 
 
 		 1094 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  31.34 
 
 		 1328 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  30 
 
 		 828 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  30.96 
 
 		 1517 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  33.77 
 
 		 1201 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  31.6 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  29.39 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  25.71 
 
 		 760 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  29.14 
 
 		 649 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  28.57 
 
 		 409 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  32.44 
 
 		 974 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  26.33 
 
 		 470 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  25.63 
 
 		 406 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  26.17 
 
 		 2497 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.97 
 
 		 868 aa  51.6  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 1282 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  23.45 
 
 		 2652 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  27.03 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.61 
 
 		 242 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  23.37 
 
 		 539 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  27.4 
 
 		 2031 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.4 
 
 		 2031 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.4 
 
 		 2031 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1806 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1825 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1825 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  28.74 
 
 		 2413 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.74 
 
 		 1225 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.58 
 
 		 1222 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  28.57 
 
 		 254 aa  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  31.71 
 
 		 1275 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  23.38 
 
 		 2474 aa  47.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  26.23 
 
 		 1129 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.62 
 
 		 242 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0330  FG-GAP repeat protein  25.08 
 
 		 732 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.87032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.21 
 
 		 1976 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.92 
 
 		 2032 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  27.75 
 
 		 514 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  25.54 
 
 		 402 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  25.35 
 
 		 338 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.36 
 
 		 3197 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  25 
 
 		 491 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  25.17 
 
 		 1348 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  25.72 
 
 		 506 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.35 
 
 		 338 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8159  hypothetical protein  26.51 
 
 		 293 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.89 
 
 		 940 aa  43.9  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>