More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1381 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  100 
 
 		 491 aa  978    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  88.41 
 
 		 514 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  43.3 
 
 		 883 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  35.73 
 
 		 1094 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  46.49 
 
 		 1201 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  45.56 
 
 		 534 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.39 
 
 		 868 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  38.19 
 
 		 649 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  40.74 
 
 		 506 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  31.9 
 
 		 288 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  44.44 
 
 		 304 aa  93.6  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  38.69 
 
 		 433 aa  90.9  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  50 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  49.06 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  48.91 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  58.33 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  49.47 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  49.06 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  37.22 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  48.94 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  58.33 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  24.37 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  53.66 
 
 		 324 aa  79.7  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  51.85 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  47.92 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  48.42 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  46.39 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  44.33 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  56.63 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  47.83 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  44.33 
 
 		 680 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  34.31 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  52.44 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  44.74 
 
 		 539 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  44.33 
 
 		 676 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  50.63 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  51.22 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  50 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  47.37 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  45.36 
 
 		 690 aa  77  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  45.36 
 
 		 695 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  44.33 
 
 		 692 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  36.59 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  44.57 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  49.4 
 
 		 651 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  42.52 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  51.9 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  48.78 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  52.05 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  40.52 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  51.81 
 
 		 751 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  44.9 
 
 		 648 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  44.04 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  53.42 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  44.57 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  50.63 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  47.06 
 
 		 651 aa  74.7  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  48.78 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  50.68 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  47.06 
 
 		 651 aa  74.7  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  44.12 
 
 		 697 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  34.76 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  39.09 
 
 		 640 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  48.35 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  44.12 
 
 		 697 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  48.78 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  49.38 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  54.55 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  43.14 
 
 		 699 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  43.3 
 
 		 687 aa  73.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40.34 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  44.76 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  38.18 
 
 		 640 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  51.04 
 
 		 229 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43.14 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  48.1 
 
 		 695 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  48.42 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  38.89 
 
 		 342 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  49.38 
 
 		 312 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  35.57 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  39.64 
 
 		 646 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  49.32 
 
 		 282 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  45.36 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  48.94 
 
 		 316 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  47.37 
 
 		 538 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  41.84 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  42.16 
 
 		 681 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  48.75 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  56 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  47.25 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  32.62 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  55.06 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  38.53 
 
 		 550 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  50 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  44.57 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  50 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  33.85 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  47.56 
 
 		 253 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  41.76 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  42.86 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>