39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4971 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  100 
 
 
3041 aa  6027    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  72.05 
 
 
940 aa  444  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  62.19 
 
 
3193 aa  437  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  65.77 
 
 
912 aa  431  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  60.84 
 
 
690 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.26 
 
 
1154 aa  319  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.88 
 
 
1372 aa  313  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  38.14 
 
 
470 aa  180  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  38.63 
 
 
760 aa  147  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  39.45 
 
 
1308 aa  139  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  32.67 
 
 
688 aa  139  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  31.33 
 
 
539 aa  127  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  32.11 
 
 
828 aa  113  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.9 
 
 
2346 aa  112  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  30.49 
 
 
861 aa  110  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  36.33 
 
 
409 aa  108  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  36.7 
 
 
417 aa  104  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  44.53 
 
 
8871 aa  103  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  30 
 
 
974 aa  82.8  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1707  peptidase domain protein  42.45 
 
 
365 aa  81.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000297847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  26.47 
 
 
506 aa  80.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  26.36 
 
 
1201 aa  67  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.15 
 
 
826 aa  65.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.14 
 
 
3168 aa  63.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  29.08 
 
 
1490 aa  59.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.22 
 
 
1225 aa  56.2  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.34 
 
 
1222 aa  56.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.83 
 
 
1340 aa  54.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.4 
 
 
604 aa  53.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.72 
 
 
2194 aa  53.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  29.93 
 
 
12741 aa  53.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  29.21 
 
 
1126 aa  53.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2925  hypothetical protein  36.96 
 
 
3138 aa  52  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.844856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  33.33 
 
 
264 aa  51.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.9 
 
 
1275 aa  50.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2944  glutamine cyclotransferase  32.22 
 
 
264 aa  49.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2900  glutamine cyclotransferase  32.22 
 
 
264 aa  49.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  24.6 
 
 
223 aa  48.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  20.26 
 
 
715 aa  46.2  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>