194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2980 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  100 
 
 		 1126 aa  2219    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  34.16 
 
 		 974 aa  299  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  55.8 
 
 		 1189 aa  280  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  50.18 
 
 		 1083 aa  237  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_2079  hypothetical protein  44.47 
 
 		 709 aa  233  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  45.45 
 
 		 924 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  45.26 
 
 		 673 aa  214  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  45.68 
 
 		 968 aa  214  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  44.53 
 
 		 1117 aa  207  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  31.28 
 
 		 872 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  45.62 
 
 		 1182 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  41.35 
 
 		 604 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  32.32 
 
 		 828 aa  188  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  28.3 
 
 		 1124 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.52 
 
 		 1340 aa  184  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  43.12 
 
 		 847 aa  184  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.5 
 
 		 1118 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  50.82 
 
 		 833 aa  180  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.3 
 
 		 2194 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.89 
 
 		 1019 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.24 
 
 		 1222 aa  170  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.33 
 
 		 1113 aa  169  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  40.88 
 
 		 1490 aa  168  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  39.29 
 
 		 1838 aa  165  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  32.3 
 
 		 1275 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.64 
 
 		 1225 aa  160  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.37 
 
 		 889 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.36 
 
 		 891 aa  143  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.07 
 
 		 1009 aa  142  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  35.21 
 
 		 2807 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  33.49 
 
 		 1638 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.23 
 
 		 813 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  35.69 
 
 		 412 aa  125  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.54 
 
 		 1012 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  32.37 
 
 		 1557 aa  121  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  39.44 
 
 		 386 aa  118  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  34.18 
 
 		 4379 aa  116  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  30.45 
 
 		 554 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  33.8 
 
 		 1289 aa  108  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  35.67 
 
 		 469 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  32.46 
 
 		 616 aa  102  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  31.39 
 
 		 494 aa  99  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  33.8 
 
 		 472 aa  96.3  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  32.93 
 
 		 485 aa  94.7  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  27.05 
 
 		 917 aa  94  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 		 657 aa  90.1  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  30.12 
 
 		 447 aa  88.6  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.27 
 
 		 11716 aa  88.2  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  32.94 
 
 		 3197 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  31.66 
 
 		 644 aa  86.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  33.57 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1127 aa  85.1  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.38 
 
 		 959 aa  84  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.78 
 
 		 3197 aa  81.6  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.89 
 
 		 621 aa  76.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  35.75 
 
 		 663 aa  76.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  27.59 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  28.12 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  29.32 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  27.56 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  29.5 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 404 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  30.16 
 
 		 463 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  26.97 
 
 		 524 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  25.79 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.67 
 
 		 1154 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  25.35 
 
 		 1346 aa  69.7  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0386  hypothetical protein  47.54 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  32.77 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1328 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.37 
 
 		 1226 aa  68.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  26.23 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  25.54 
 
 		 437 aa  67.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 		 635 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  26.76 
 
 		 435 aa  67.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  26.78 
 
 		 569 aa  67.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.15 
 
 		 737 aa  67  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  30.8 
 
 		 760 aa  67  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  25.16 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  29.41 
 
 		 690 aa  64.7  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  27.25 
 
 		 409 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  30.27 
 
 		 720 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.37 
 
 		 1192 aa  63.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.41 
 
 		 453 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  28.53 
 
 		 2474 aa  62.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.94 
 
 		 1170 aa  63.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.21 
 
 		 1114 aa  62.4  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  26.76 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  26.3 
 
 		 593 aa  62  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.69 
 
 		 803 aa  61.6  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.86 
 
 		 1228 aa  61.6  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  26.41 
 
 		 1129 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  25.96 
 
 		 649 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  27.27 
 
 		 1109 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.91 
 
 		 1246 aa  60.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  29.49 
 
 		 658 aa  59.3  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  59.3  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  28.62 
 
 		 590 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  28.52 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  29.21 
 
 		 837 aa  58.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>