More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4186 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  100 
 
 		 760 aa  1520    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  40.73 
 
 		 861 aa  239  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  42.24 
 
 		 688 aa  217  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  38.23 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  47.81 
 
 		 828 aa  204  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  30.36 
 
 		 539 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  39.52 
 
 		 1308 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.33 
 
 		 1372 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.82 
 
 		 1154 aa  154  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  37.5 
 
 		 690 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  38.63 
 
 		 3041 aa  147  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  34.81 
 
 		 940 aa  143  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  38.57 
 
 		 3193 aa  141  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  38.21 
 
 		 417 aa  134  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  35.31 
 
 		 409 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  31.65 
 
 		 506 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  36.11 
 
 		 912 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  41.52 
 
 		 5769 aa  88.2  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  36.41 
 
 		 2452 aa  82  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  41.67 
 
 		 4106 aa  81.6  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  32.52 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  43.09 
 
 		 1699 aa  79  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  43.59 
 
 		 5218 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 2704 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 2537 aa  75.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  41.88 
 
 		 8682 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.43 
 
 		 5839 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  38.93 
 
 		 2296 aa  74.3  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  34.05 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1538 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  40.17 
 
 		 9030 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  53.33 
 
 		 855 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.94 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  40.5 
 
 		 1582 aa  71.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.51 
 
 		 1016 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  37.5 
 
 		 2542 aa  70.5  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  51.39 
 
 		 2329 aa  70.5  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  44.23 
 
 		 1175 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  42.48 
 
 		 1055 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  42.48 
 
 		 1712 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  42.48 
 
 		 2775 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.79 
 
 		 5962 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.35 
 
 		 2678 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  38.66 
 
 		 867 aa  69.7  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  44.55 
 
 		 4678 aa  69.7  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.65 
 
 		 868 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  48.84 
 
 		 2954 aa  69.3  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  35.64 
 
 		 1883 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  39.82 
 
 		 782 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.21 
 
 		 588 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  45 
 
 		 1346 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  38.84 
 
 		 727 aa  68.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  34.22 
 
 		 2567 aa  69.3  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  43.75 
 
 		 3954 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  52.05 
 
 		 615 aa  68.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  54.41 
 
 		 589 aa  68.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  44.9 
 
 		 3314 aa  68.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  30.18 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  32.02 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  52 
 
 		 3619 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  43.08 
 
 		 4285 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  52 
 
 		 3619 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  47.3 
 
 		 679 aa  67.8  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  45.26 
 
 		 1156 aa  67.4  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  31.27 
 
 		 1094 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  34.84 
 
 		 3209 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.78 
 
 		 2346 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  30.8 
 
 		 1126 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  40.95 
 
 		 585 aa  67  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  51.32 
 
 		 1499 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  42.39 
 
 		 833 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  43.88 
 
 		 686 aa  66.6  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.37 
 
 		 1019 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  41.03 
 
 		 786 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  50.68 
 
 		 1287 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  35.47 
 
 		 2667 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  47.19 
 
 		 1202 aa  66.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.71 
 
 		 620 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  53.85 
 
 		 2911 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  52 
 
 		 243 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2871  Animal heme peroxidase  43.21 
 
 		 1712 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  52 
 
 		 3427 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 		 1963 aa  66.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  42.16 
 
 		 982 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  48 
 
 		 850 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  39.26 
 
 		 856 aa  65.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  41.94 
 
 		 1166 aa  65.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  46.07 
 
 		 824 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  51.32 
 
 		 1164 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  43.82 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  38.46 
 
 		 6753 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  38.97 
 
 		 1480 aa  64.7  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  40 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 2097 aa  64.7  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  28.39 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  32.51 
 
 		 883 aa  64.3  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  44 
 
 		 980 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  46.05 
 
 		 161 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  39.42 
 
 		 16322 aa  64.3  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  53.73 
 
 		 942 aa  63.9  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>