102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0616 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 386 aa  733    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.87 
 
 		 1118 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.03 
 
 		 1009 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.6 
 
 		 1222 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.96 
 
 		 2194 aa  229  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.7 
 
 		 1340 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.15 
 
 		 1113 aa  226  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  44.51 
 
 		 412 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.01 
 
 		 1225 aa  220  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.27 
 
 		 889 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.68 
 
 		 1019 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.64 
 
 		 891 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  36.64 
 
 		 1838 aa  193  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  37.02 
 
 		 828 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  37.13 
 
 		 2807 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.14 
 
 		 1012 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  33.62 
 
 		 1557 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  32.52 
 
 		 872 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  31.94 
 
 		 813 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  34.53 
 
 		 1289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  41.4 
 
 		 662 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  35.5 
 
 		 1490 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  31.56 
 
 		 644 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  30.32 
 
 		 4379 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  37.28 
 
 		 1126 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  34.44 
 
 		 974 aa  119  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  29.94 
 
 		 554 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  34.17 
 
 		 1275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  32.68 
 
 		 604 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  32.53 
 
 		 616 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  36.31 
 
 		 657 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  36.13 
 
 		 663 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  32.09 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  31.85 
 
 		 3197 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  33.48 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  30.12 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.08 
 
 		 3197 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  30.87 
 
 		 494 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  29.97 
 
 		 685 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  25.17 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  37.95 
 
 		 837 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  28.72 
 
 		 1124 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  31.78 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  44.55 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  28.68 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  27.86 
 
 		 917 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  29.45 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 1127 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  28.12 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.86 
 
 		 959 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  30.54 
 
 		 447 aa  62.8  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  29.46 
 
 		 1022 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  26.95 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  26.4 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  34.59 
 
 		 720 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  31.38 
 
 		 1527 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.22 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  27.56 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.38 
 
 		 600 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3385  FG-GAP repeat-containing protein  26.76 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  27.08 
 
 		 2113 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  27.81 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  31.74 
 
 		 1638 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1575 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.97 
 
 		 11716 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  43.06 
 
 		 110 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 		 621 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  31.27 
 
 		 730 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2553  hypothetical protein  30.53 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336859  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.99 
 
 		 2031 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  32.89 
 
 		 508 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.99 
 
 		 2031 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  29.31 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  25.82 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1806 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1825 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1825 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  27.99 
 
 		 2031 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  30.37 
 
 		 593 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  26.07 
 
 		 499 aa  47  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  25.12 
 
 		 645 aa  46.6  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.15 
 
 		 546 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  29.04 
 
 		 2417 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  29.04 
 
 		 2458 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  25.62 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  26.87 
 
 		 760 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.91 
 
 		 604 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.38 
 
 		 1192 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  26.9 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.1 
 
 		 690 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  29.59 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  25.26 
 
 		 1328 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  28.91 
 
 		 1098 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.3 
 
 		 2032 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  24.52 
 
 		 2413 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.81 
 
 		 551 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  23.21 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.72 
 
 		 677 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.06 
 
 		 574 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.16 
 
 		 1114 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>