42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2178 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  100 
 
 		 883 aa  1793    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  55.36 
 
 		 534 aa  327  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  56.12 
 
 		 1201 aa  307  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  53.36 
 
 		 1094 aa  300  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  42.11 
 
 		 514 aa  221  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  43.3 
 
 		 491 aa  220  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  45.58 
 
 		 649 aa  197  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  33.94 
 
 		 288 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.08 
 
 		 868 aa  144  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2296  hypothetical protein  31.7 
 
 		 353 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.74 
 
 		 620 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1328 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  33.9 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1517 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  29.19 
 
 		 562 aa  72  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1025  hypothetical protein  35.02 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  31.14 
 
 		 828 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  26.69 
 
 		 690 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.49 
 
 		 1019 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  32.51 
 
 		 760 aa  64.3  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  31.8 
 
 		 685 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  30.59 
 
 		 254 aa  63.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1289 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  29.76 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  26.64 
 
 		 2528 aa  57.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.01 
 
 		 1154 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  25.74 
 
 		 417 aa  55.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 571 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  28 
 
 		 506 aa  52.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  26.34 
 
 		 409 aa  51.6  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  25.19 
 
 		 539 aa  51.2  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  30.69 
 
 		 861 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.01 
 
 		 974 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  26.65 
 
 		 1437 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.59 
 
 		 621 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  22.32 
 
 		 2497 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.87 
 
 		 1126 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  25.29 
 
 		 657 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.12 
 
 		 1225 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  24.92 
 
 		 1346 aa  44.3  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2057  FG-GAP repeat-containing protein  32.81 
 
 		 282 aa  44.3  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  26.13 
 
 		 312 aa  44.3  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>