32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2569 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 685 aa  1382    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  73.17 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  76.49 
 
 		 571 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4450  hypothetical protein  36.64 
 
 		 421 aa  264  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385348  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5044  hypothetical protein  40.93 
 
 		 769 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8845  hypothetical protein  35.95 
 
 		 371 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.11 
 
 		 485 aa  193  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.83 
 
 		 609 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  30.61 
 
 		 627 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  34.81 
 
 		 658 aa  85.5  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  28.51 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.3 
 
 		 794 aa  75.1  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.24 
 
 		 959 aa  73.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  31.8 
 
 		 883 aa  63.9  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.56 
 
 		 1154 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.76 
 
 		 1340 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.37 
 
 		 3197 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.49 
 
 		 1113 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.51 
 
 		 1222 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  28.76 
 
 		 649 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8159  hypothetical protein  30.17 
 
 		 293 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  27.48 
 
 		 1037 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.3 
 
 		 1225 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  28.77 
 
 		 811 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.92 
 
 		 1275 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.5 
 
 		 3197 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.11 
 
 		 1372 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0330  FG-GAP repeat protein  26.6 
 
 		 732 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.87032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  28.87 
 
 		 2448 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  29.89 
 
 		 690 aa  44.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  24.28 
 
 		 491 aa  44.3  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  31.49 
 
 		 1126 aa  43.9  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>