48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2642 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  100 
 
 		 649 aa  1326    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1284  metallophosphoesterase  39.12 
 
 		 506 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  45.58 
 
 		 883 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  45.14 
 
 		 534 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  38.19 
 
 		 491 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  41.43 
 
 		 1094 aa  172  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  39.08 
 
 		 514 aa  170  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  40.16 
 
 		 1201 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2279  metallophosphoesterase  32.92 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  29.34 
 
 		 492 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.32 
 
 		 868 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  29.91 
 
 		 890 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  38.83 
 
 		 288 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0744  metallophosphoesterase  31.85 
 
 		 318 aa  114  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.110446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5736  hypothetical protein  27.03 
 
 		 683 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3973  metallophosphoesterase  27.96 
 
 		 357 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  26.14 
 
 		 459 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4590  putative modular protein  24.85 
 
 		 702 aa  90.9  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4853  metallophosphoesterase  27.3 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1616  cell wall anchor domain-containing protein  24.24 
 
 		 757 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  28.93 
 
 		 2105 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.17 
 
 		 2668 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3300  putative secreted protein  25.31 
 
 		 662 aa  80.5  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3092  hypothetical protein  24.79 
 
 		 447 aa  77  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.932849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2692  secreted protein  26.01 
 
 		 574 aa  77  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22750  Calcineurin-like phosphoesterase  23.71 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.623762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.14 
 
 		 620 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1328 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  28.89 
 
 		 828 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.76 
 
 		 1019 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.4 
 
 		 690 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1517 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  29.39 
 
 		 456 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  29.03 
 
 		 760 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  31.61 
 
 		 562 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  28.76 
 
 		 685 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  28.57 
 
 		 254 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  36.43 
 
 		 1275 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  27.5 
 
 		 690 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.3 
 
 		 1154 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.37 
 
 		 1340 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  30.17 
 
 		 1527 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  28.65 
 
 		 463 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.05 
 
 		 1225 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1025  hypothetical protein  37.75 
 
 		 288 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.87 
 
 		 1126 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.51 
 
 		 1009 aa  43.9  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 		 571 aa  43.9  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>