67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3145 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  45.39 
 
 		 1337 aa  1060    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  45.88 
 
 		 1348 aa  1048    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 1346 aa  2726    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  44.43 
 
 		 1433 aa  957    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  43.51 
 
 		 1437 aa  929    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  37.56 
 
 		 752 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  34.9 
 
 		 749 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  32.57 
 
 		 702 aa  166  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  32.78 
 
 		 1434 aa  159  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  34.27 
 
 		 640 aa  142  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  32.8 
 
 		 1827 aa  141  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.24 
 
 		 11716 aa  139  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  33.41 
 
 		 937 aa  139  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  31.54 
 
 		 621 aa  137  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.61 
 
 		 2507 aa  136  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  27.35 
 
 		 706 aa  122  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.62 
 
 		 1073 aa  115  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  31.37 
 
 		 503 aa  107  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  29.13 
 
 		 2064 aa  100  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  27.52 
 
 		 811 aa  95.9  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  29.55 
 
 		 819 aa  95.1  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  30.68 
 
 		 885 aa  95.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  28.44 
 
 		 500 aa  92.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  26.78 
 
 		 935 aa  73.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  30.79 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25.35 
 
 		 1126 aa  69.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.85 
 
 		 621 aa  65.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.07 
 
 		 959 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  26.23 
 
 		 1172 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  26.88 
 
 		 404 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.19 
 
 		 974 aa  60.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 		 1118 aa  59.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 		 635 aa  58.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.5 
 
 		 2807 aa  56.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  27.82 
 
 		 447 aa  55.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.52 
 
 		 1490 aa  55.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.47 
 
 		 1012 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  24.22 
 
 		 828 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  31.88 
 
 		 485 aa  54.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  33.96 
 
 		 458 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.53 
 
 		 1340 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  26.82 
 
 		 494 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.99 
 
 		 1154 aa  52.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.12 
 
 		 3193 aa  52  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  23.81 
 
 		 917 aa  51.6  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  24.41 
 
 		 1127 aa  51.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.76 
 
 		 1113 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  24.1 
 
 		 2762 aa  49.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  31.98 
 
 		 458 aa  48.5  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  27.44 
 
 		 524 aa  48.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  25.93 
 
 		 456 aa  48.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.11 
 
 		 1225 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25.16 
 
 		 1129 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1194 aa  47.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  24.91 
 
 		 1109 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.99 
 
 		 690 aa  47  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  26.85 
 
 		 539 aa  46.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  33.8 
 
 		 1668 aa  46.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.23 
 
 		 668 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  25.77 
 
 		 690 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0445  FG-GAP repeat protein  31.08 
 
 		 964 aa  45.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.265676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  25.68 
 
 		 483 aa  45.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.39 
 
 		 1537 aa  45.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  25.67 
 
 		 470 aa  45.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  26.03 
 
 		 1124 aa  45.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  21.32 
 
 		 406 aa  45.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  25.58 
 
 		 435 aa  45.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>