56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1530 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  100 
 
 		 1537 aa  2982    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  45.19 
 
 		 680 aa  357  8.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  42.34 
 
 		 682 aa  329  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41.64 
 
 		 680 aa  328  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  38.89 
 
 		 680 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.3 
 
 		 693 aa  268  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  40 
 
 		 659 aa  261  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.43 
 
 		 587 aa  257  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  37.57 
 
 		 609 aa  254  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.33 
 
 		 548 aa  254  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  42.27 
 
 		 674 aa  233  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 691 aa  230  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  36.06 
 
 		 684 aa  227  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.97 
 
 		 529 aa  224  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.2 
 
 		 575 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.14 
 
 		 590 aa  205  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  36.25 
 
 		 676 aa  203  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.63 
 
 		 824 aa  171  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  36.76 
 
 		 406 aa  171  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.68 
 
 		 830 aa  171  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  33.89 
 
 		 706 aa  168  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1734  hypothetical protein  37.63 
 
 		 615 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00167071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  33.33 
 
 		 404 aa  161  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  31.21 
 
 		 666 aa  152  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.71 
 
 		 627 aa  152  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  29.67 
 
 		 651 aa  139  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  28.93 
 
 		 466 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.92 
 
 		 486 aa  127  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  54.55 
 
 		 232 aa  119  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4091  hypothetical protein  39.26 
 
 		 303 aa  116  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319717  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.16 
 
 		 1672 aa  109  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  51.65 
 
 		 143 aa  93.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  28.9 
 
 		 444 aa  92.4  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.75 
 
 		 449 aa  91.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3573  hypothetical protein  43.97 
 
 		 510 aa  80.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0204889  normal  0.0163227 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3463  hypothetical protein  44.36 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.595697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.4 
 
 		 595 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3546  hypothetical protein  44.36 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.247744  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46170  predicted protein  26.55 
 
 		 1069 aa  72.8  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3614  hypothetical protein  43.61 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661143  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  35.53 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0351  hypothetical protein  42.05 
 
 		 495 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.97012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2587  hypothetical protein  30.79 
 
 		 410 aa  67  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.279749  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  27.87 
 
 		 645 aa  63.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2680  hypothetical protein  32.89 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  30.81 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  23.81 
 
 		 692 aa  62.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0364  hypothetical protein  38.57 
 
 		 495 aa  61.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  31.51 
 
 		 458 aa  60.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  28.52 
 
 		 431 aa  57.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0337  hypothetical protein  39.67 
 
 		 496 aa  55.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  28.77 
 
 		 1538 aa  51.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3560  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.11 
 
 		 472 aa  48.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  35.03 
 
 		 937 aa  47.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  25.19 
 
 		 1437 aa  47.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  30.39 
 
 		 1346 aa  45.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>