42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0596 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  81.47 
 
 		 680 aa  1086    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  55.65 
 
 		 680 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  100 
 
 		 680 aa  1352    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  51.98 
 
 		 682 aa  613  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  44.13 
 
 		 693 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  51.6 
 
 		 659 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  51.97 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  46.1 
 
 		 674 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  40.2 
 
 		 587 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.54 
 
 		 691 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  39.54 
 
 		 590 aa  337  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  42.89 
 
 		 529 aa  336  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41.23 
 
 		 1537 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  41.09 
 
 		 575 aa  317  6e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  42.86 
 
 		 676 aa  313  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41.83 
 
 		 609 aa  303  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  39.87 
 
 		 684 aa  299  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  41.3 
 
 		 406 aa  242  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.94 
 
 		 627 aa  219  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  33.05 
 
 		 706 aa  212  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  47.96 
 
 		 232 aa  187  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  30.47 
 
 		 666 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.91 
 
 		 830 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  27.59 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.79 
 
 		 824 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.54 
 
 		 404 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.34 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  26.82 
 
 		 651 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.48 
 
 		 1672 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  53.93 
 
 		 143 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  24.08 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  26.88 
 
 		 431 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  23.69 
 
 		 449 aa  63.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  24.16 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  24.13 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  25.98 
 
 		 645 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3560  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.67 
 
 		 472 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.58 
 
 		 595 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  22.41 
 
 		 692 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46170  predicted protein  29.58 
 
 		 1069 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  32.99 
 
 		 629 aa  45.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  28.35 
 
 		 458 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>