37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2823 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  100 
 
 		 444 aa  857    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  45.9 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  34.03 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.62 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  32.13 
 
 		 706 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 666 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.16 
 
 		 548 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 691 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.07 
 
 		 404 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  30.2 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.95 
 
 		 575 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  26.71 
 
 		 529 aa  93.6  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.9 
 
 		 1537 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.15 
 
 		 824 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.06 
 
 		 659 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.44 
 
 		 609 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.25 
 
 		 680 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.31 
 
 		 587 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.25 
 
 		 674 aa  86.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  25.77 
 
 		 684 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  24.08 
 
 		 680 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.24 
 
 		 680 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  30.02 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.34 
 
 		 590 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.27 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.56 
 
 		 693 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  25.28 
 
 		 651 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.1 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.98 
 
 		 676 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.43 
 
 		 830 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  25.54 
 
 		 645 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.13 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46170  predicted protein  32.19 
 
 		 1069 aa  60.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  25.22 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  32.77 
 
 		 1538 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  35.87 
 
 		 143 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  20.43 
 
 		 692 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>