76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0169 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1291    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1807  murein endopeptidase  38.39 
 
 		 386 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2073  protease, putative  38.39 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000121211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1852  protease  38.71 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000203248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1995  protease  38.71 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000762612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1509  transglutaminase domain-containing protein  36.62 
 
 		 386 aa  252  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000210837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1858  transglutaminase domain-containing protein  35.69 
 
 		 386 aa  252  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000428903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2028  putative protease  38.76 
 
 		 386 aa  251  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3332  putative protease  35.29 
 
 		 386 aa  250  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000192317  unclonable  3.65908e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1823  murein endopeptidase  38.11 
 
 		 386 aa  250  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.57805e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1997  putative protease  35.01 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000694194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2092  putative protease  37.79 
 
 		 386 aa  246  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  39.32 
 
 		 578 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  36.86 
 
 		 578 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  34.38 
 
 		 586 aa  230  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1056  putative S-layer protein  37.18 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.48899e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  37.18 
 
 		 578 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  34.64 
 
 		 578 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  39.37 
 
 		 577 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  36.86 
 
 		 577 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  34.73 
 
 		 577 aa  226  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  36.86 
 
 		 577 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  38.64 
 
 		 578 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  36.57 
 
 		 466 aa  127  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1856  transglutaminase domain-containing protein  37.63 
 
 		 363 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0548672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  34.76 
 
 		 1710 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  55.67 
 
 		 1672 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03940  Transglutaminase-like superfamily protein  35.79 
 
 		 346 aa  99.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.474674  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22380  hypothetical protein  34.44 
 
 		 397 aa  87.8  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  50.48 
 
 		 2296 aa  88.2  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1030 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0758  putative lipoprotein  35.29 
 
 		 718 aa  70.5  0.00000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1491  hypothetical protein  32.37 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00542195  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0843  putative lipoprotein  31.3 
 
 		 744 aa  67.8  0.0000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.277994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2077  transglutaminase domain protein  28.12 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0514  putative lipoprotein  31.3 
 
 		 756 aa  63.9  0.000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.492219  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0607  putative lipoprotein  32.69 
 
 		 818 aa  62.8  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.256534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 1013 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22960  Transglutaminase-like superfamily protein  31.45 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.26 
 
 		 1394 aa  62  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  28.37 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0513  putative lipoprotein  37.36 
 
 		 747 aa  61.2  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2490  hypothetical protein  45.36 
 
 		 448 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  40.43 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0755  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.58 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00219053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2123  transglutaminase domain-containing protein  33.61 
 
 		 773 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.034622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  36.89 
 
 		 1351 aa  58.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  37.5 
 
 		 2392 aa  58.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  38.54 
 
 		 1732 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.43 
 
 		 587 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  37.62 
 
 		 1467 aa  53.5  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  33 
 
 		 343 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  33.66 
 
 		 232 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0487  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.02 
 
 		 455 aa  51.6  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 1937 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08210  SH3 domain protein (Cyk3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03400)  22.47 
 
 		 1789 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1073  hypothetical protein  40.79 
 
 		 84 aa  51.6  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.680757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  25.53 
 
 		 726 aa  50.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.33 
 
 		 680 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  24.37 
 
 		 280 aa  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  27.93 
 
 		 260 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  24.32 
 
 		 576 aa  47.4  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1704  transglutaminase domain protein  31.25 
 
 		 423 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.93 
 
 		 680 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  29.47 
 
 		 266 aa  46.2  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  28.91 
 
 		 391 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  28.91 
 
 		 391 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  27.03 
 
 		 288 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3465  hypothetical protein  32.61 
 
 		 416 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00393007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22850  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.87 
 
 		 259 aa  43.9  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2888  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.95 
 
 		 356 aa  43.9  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.057915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2342  coagulation factor 5/8 type domain protein  30 
 
 		 350 aa  43.9  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  25.45 
 
 		 290 aa  43.9  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2471  transglutaminase domain-containing protein  23.77 
 
 		 326 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>