More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5599 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 288 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  65.77 
 
 		 271 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  53.88 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  52.24 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  55.1 
 
 		 265 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  52.34 
 
 		 260 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  55.1 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  51.15 
 
 		 266 aa  271  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  43.98 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  44.06 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  42.65 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  40.84 
 
 		 283 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  40.46 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  38.57 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  40.94 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  38.91 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  40.08 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  40.38 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  40.6 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  39.62 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  40.45 
 
 		 279 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  40.38 
 
 		 281 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  40.45 
 
 		 279 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  40.08 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  38.93 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  39.71 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  38.93 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  38.58 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  38.38 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  37.64 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  38.95 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  39.54 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  36.92 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  36.6 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  38.98 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  37.4 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  37.78 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  38.64 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  38.95 
 
 		 290 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  37.36 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  37.78 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  37.41 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  38.26 
 
 		 270 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  36.94 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  36.98 
 
 		 290 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  36.98 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  37.04 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  36.98 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  35.21 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  35.45 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  39.85 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  36.59 
 
 		 276 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  36.25 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  36.26 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  38.91 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  37.17 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  34.35 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  34.72 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  34.72 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  36.3 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  34.91 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  35.5 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  43.33 
 
 		 367 aa  158  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  35.07 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  39.11 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  34.44 
 
 		 286 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  36.58 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  36.73 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 260 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  34.75 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  38.94 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  31.42 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  33.97 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  40.28 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  31.66 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  36.79 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  35.21 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  39.75 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  32.82 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  39.1 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  31.52 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  31.52 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  31.52 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  30.87 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  28.09 
 
 		 266 aa  92.4  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  30.12 
 
 		 280 aa  92.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  34.6 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  31.38 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  29.57 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  30.67 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  30.67 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  30.67 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.44 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  28.63 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  36.76 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  28.69 
 
 		 273 aa  86.3  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  30.9 
 
 		 279 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  28.4 
 
 		 266 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  27.84 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  29.52 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>