More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4391 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  41.8 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  43.49 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  43.36 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  42.47 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  47.08 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  42.86 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  39.39 
 
 		 281 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  35.47 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  41.13 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  41.04 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  43.13 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  40 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  39.62 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  37.59 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  41.73 
 
 		 291 aa  175  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  39.62 
 
 		 286 aa  174  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  36.88 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  36.94 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  36.8 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  42.08 
 
 		 281 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  35.58 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  35.5 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  49.68 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  35.27 
 
 		 367 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  47.53 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  44.12 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  37.08 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  34.72 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  34.72 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  34.72 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  34.46 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  31.78 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  42.07 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  34.47 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  36.67 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  37 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  32.83 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  30.15 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  31.54 
 
 		 276 aa  121  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  29.28 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  31.6 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  30.8 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  31.97 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  34.83 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  28.78 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  35.43 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  29.93 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  36.71 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  35.26 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  33.71 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  34.64 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  31.92 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  35.84 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  35.59 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  29.52 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  35.93 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  27.17 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  27.47 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  31.98 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  33.15 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  30.18 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  34.88 
 
 		 310 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  34.88 
 
 		 283 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  28.85 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  34.48 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  35.62 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  34.48 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  34.39 
 
 		 292 aa  95.1  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  29.34 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  27.61 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  32.76 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  32.95 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  32.37 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  28.84 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  34.78 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  30.86 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  31.98 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  37.21 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  33.53 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  40.58 
 
 		 281 aa  85.1  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  27.12 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.12 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  32.12 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  32.54 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  32.12 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  31.95 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  36.67 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  32.21 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  36.13 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  29.69 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  30 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  34.27 
 
 		 340 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  36.17 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  36.17 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>