More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2641 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  100 
 
 
279 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  86.38 
 
 
279 aa  507  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  86.74 
 
 
279 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  72.76 
 
 
295 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  73.14 
 
 
282 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  70.85 
 
 
272 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  70.85 
 
 
276 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  66.05 
 
 
282 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  63.25 
 
 
283 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  64.58 
 
 
310 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  64.81 
 
 
277 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  62.55 
 
 
275 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  62.41 
 
 
269 aa  355  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  61.05 
 
 
267 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  60.45 
 
 
268 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  60.89 
 
 
275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  60.15 
 
 
280 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  59.18 
 
 
270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  55.27 
 
 
283 aa  329  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  55.68 
 
 
273 aa  324  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  54.51 
 
 
280 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  55.96 
 
 
280 aa  316  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  56.62 
 
 
280 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  57.88 
 
 
271 aa  314  8e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  53.14 
 
 
279 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  55.93 
 
 
294 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  53.82 
 
 
275 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  55.73 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  51.61 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  51.66 
 
 
278 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  50.19 
 
 
267 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  51.29 
 
 
275 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  50.56 
 
 
290 aa  298  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  53.7 
 
 
272 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  53.16 
 
 
270 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  53.18 
 
 
276 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  52.79 
 
 
270 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  48.31 
 
 
294 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  44.79 
 
 
273 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  37.82 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  38.38 
 
 
288 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  39.84 
 
 
260 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  39.83 
 
 
276 aa  191  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  38.82 
 
 
266 aa  178  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  36.43 
 
 
266 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  35.96 
 
 
265 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  34.7 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  37.59 
 
 
284 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  37.45 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  37.04 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  37.45 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  40.62 
 
 
327 aa  158  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  36.5 
 
 
291 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  42.11 
 
 
293 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  34.98 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  33.85 
 
 
282 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  34.31 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  36.33 
 
 
367 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  34.51 
 
 
286 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  36.36 
 
 
286 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  32.25 
 
 
286 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  32.62 
 
 
286 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  32.62 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  35.47 
 
 
285 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  39.63 
 
 
286 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  36.49 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  33.19 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  32.67 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  34.64 
 
 
261 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  30.86 
 
 
261 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  38.36 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.63 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  29.63 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  29.63 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  29.63 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  29.15 
 
 
289 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  35.2 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  28.29 
 
 
268 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  33.04 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  33.73 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  33.54 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  33.75 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  32.92 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  28.06 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  32.37 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  35.96 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  29.07 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  27.48 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.62 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  27.54 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  29.29 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  27.92 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  26.05 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  26.07 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  26.07 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  26.07 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  30.04 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2845  transglutaminase domain protein  26.52 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  28.44 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>