More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6059 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  80.66 
 
 		 295 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  69.49 
 
 		 272 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  70.85 
 
 		 279 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  68.01 
 
 		 279 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  69.71 
 
 		 282 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  67.65 
 
 		 279 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  66.54 
 
 		 269 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  61.99 
 
 		 282 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  62.83 
 
 		 283 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  61.82 
 
 		 275 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  61.34 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  59.26 
 
 		 273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  61.8 
 
 		 268 aa  351  8.999999999999999e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  60.3 
 
 		 270 aa  341  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  59.85 
 
 		 277 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  58.91 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  59.41 
 
 		 275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  54.71 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  54.61 
 
 		 275 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  58.43 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  54.58 
 
 		 275 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  58.43 
 
 		 280 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  55.51 
 
 		 283 aa  318  7e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  53.9 
 
 		 279 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  57.41 
 
 		 294 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  58.09 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  52.81 
 
 		 267 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  52.81 
 
 		 290 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  53.51 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  54.31 
 
 		 276 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  54.24 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  55.93 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  55.39 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  53.87 
 
 		 270 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  53.51 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  53.56 
 
 		 292 aa  290  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  53.18 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  41.22 
 
 		 271 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  40.38 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  38.2 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  36.36 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  35.47 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  36.94 
 
 		 264 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  39.61 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  32.96 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  38.31 
 
 		 298 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  37.59 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  36.72 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  40.27 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  40.74 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  31.27 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  33.58 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  33.71 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  36.59 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  33.21 
 
 		 286 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  33.83 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  34.39 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  37.23 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  37.16 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  32.12 
 
 		 286 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  36.57 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  34.38 
 
 		 367 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  35.23 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  38.05 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  36.94 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  35.43 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  31.25 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  28.78 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  30.86 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  37.65 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  33.5 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  34.93 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  29.1 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  29.1 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  29.1 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  37.43 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  36.3 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  35.09 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  37.65 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  27.37 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  28.7 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  29.73 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  27.39 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  40 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  28.77 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  27.1 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  27.78 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  40.52 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  32.21 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  41.94 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  36.84 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  34.75 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  41.3 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  26.94 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  27.13 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.72 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  36.51 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>