More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4445 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 266 aa  544  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  91.73 
 
 		 266 aa  510  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  78.33 
 
 		 268 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  43.89 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  44.27 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  42.8 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  42.75 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  42.8 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  44.32 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  43.94 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  42.08 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  41.33 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  41.76 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  44.19 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  42.91 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  41.35 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  43.18 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  41.06 
 
 		 276 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  41.06 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  40.52 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  38.97 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  40.3 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  41.91 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  37.73 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  39.93 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  38.06 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  40.82 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  37.69 
 
 		 270 aa  161  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  37.59 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  36.63 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  37.04 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  39.57 
 
 		 279 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  37.45 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  34.8 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  37.45 
 
 		 296 aa  158  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  37.78 
 
 		 274 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  37.82 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  37.23 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  38.55 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  37.93 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  35.82 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  36.16 
 
 		 272 aa  155  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  34.17 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  36.13 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  38.85 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  38.08 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  37.08 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  33.93 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  38.35 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  36.5 
 
 		 269 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  36.4 
 
 		 274 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  35.77 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  36.19 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  36.64 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  38.02 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  31.91 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  31.58 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 		 326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  33.22 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  30.72 
 
 		 366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 		 367 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 		 361 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  33 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  31.4 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  32.97 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  30.36 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  30.24 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  31.4 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  30.83 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  30.14 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  32.13 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  31.17 
 
 		 339 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  30.03 
 
 		 332 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  33.45 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  30.71 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  32.19 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  31.4 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 350 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  30.03 
 
 		 340 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  28.78 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  31.62 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  29.02 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  31.4 
 
 		 304 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  28 
 
 		 295 aa  115  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  32.67 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  32.07 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  30.72 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  31.03 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  30.71 
 
 		 316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  29.55 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>