More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5583 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  100 
 
 
308 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  35.34 
 
 
323 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 
311 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  34.59 
 
 
326 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  33.82 
 
 
271 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  34.17 
 
 
316 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  33.75 
 
 
308 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  33.45 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  33.21 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  35.79 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  34.29 
 
 
272 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  33 
 
 
318 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  31.77 
 
 
281 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.98 
 
 
285 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  33.45 
 
 
292 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  35.4 
 
 
292 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  33.57 
 
 
279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  31.67 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  30.96 
 
 
273 aa  152  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  31.38 
 
 
311 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  31.36 
 
 
304 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  31.96 
 
 
319 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  31.93 
 
 
279 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  32.5 
 
 
272 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  32.12 
 
 
277 aa  150  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  31.96 
 
 
293 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 
279 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  30.85 
 
 
279 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 
279 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  30.2 
 
 
300 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  32.14 
 
 
297 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  30.36 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  30.36 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  31.14 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  31.86 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  31.71 
 
 
299 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  32.25 
 
 
288 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  29.76 
 
 
304 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  31.05 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  32.33 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  32.03 
 
 
272 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  30.48 
 
 
311 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  31.37 
 
 
299 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  32.87 
 
 
292 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  30.69 
 
 
304 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  29.61 
 
 
299 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  32.53 
 
 
295 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  31.56 
 
 
654 aa  142  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  32.29 
 
 
292 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  31.6 
 
 
292 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  32.3 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  32.3 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  30.07 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  31.06 
 
 
316 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  30.43 
 
 
296 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  32.53 
 
 
332 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  30.49 
 
 
344 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  31.05 
 
 
308 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  31.96 
 
 
305 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  30.25 
 
 
279 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  29.97 
 
 
283 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  29.62 
 
 
291 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  31.29 
 
 
297 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  29.97 
 
 
338 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  29.97 
 
 
338 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  29.97 
 
 
338 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  29.97 
 
 
340 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  31.29 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  29.9 
 
 
296 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  30.38 
 
 
283 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  30 
 
 
326 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  29.64 
 
 
340 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 
345 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.48 
 
 
339 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  29.64 
 
 
350 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  29.64 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  32.84 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  30.96 
 
 
292 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  30.16 
 
 
366 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  31.83 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  30.16 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  31.27 
 
 
314 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  29.18 
 
 
352 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  29.51 
 
 
352 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  29.84 
 
 
361 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  31.43 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  28.43 
 
 
300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  28.43 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  30.97 
 
 
330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  30.4 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  30.45 
 
 
296 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  29.41 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  30.55 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  29.68 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  31.31 
 
 
300 aa  129  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  29.04 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  28.87 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>