More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0731 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 285 aa  596  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  75.72 
 
 		 273 aa  428  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  73.72 
 
 		 272 aa  420  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  72.99 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  69.71 
 
 		 272 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  69.23 
 
 		 272 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  38.67 
 
 		 311 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  37.12 
 
 		 326 aa  198  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  39.16 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  37.67 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  36.75 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  37.06 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  34.62 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  35.48 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  35.39 
 
 		 316 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  34.34 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  34.45 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  34.8 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  32.98 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  34.56 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  33.1 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  33.1 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  33.1 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  32.88 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  32.07 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  32.89 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  34.34 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  34.9 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  34.34 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  34.34 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  33.11 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  33.67 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  34.69 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  33.67 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  32.54 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  34.56 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  33.22 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  31.1 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  31.97 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  33.8 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  34.34 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  31.8 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  36.45 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  32.76 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  31.31 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  30.74 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  32.91 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  30.92 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  32.91 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  33.09 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  32.91 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  32.28 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  32.99 
 
 		 319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  34 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  34.69 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  32.53 
 
 		 279 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  32.6 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  34.11 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  31.97 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  34.96 
 
 		 268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  32.11 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  32.18 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  31.67 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  30.48 
 
 		 344 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  30.36 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  33.72 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  33.21 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  31.11 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  32.3 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  31.29 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 		 361 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  32.65 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  31.21 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  32.38 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  30.7 
 
 		 366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  31.43 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  30.7 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  29.37 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  31.75 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  31.76 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  31.43 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  30.79 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  34.19 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  33.69 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  33.22 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  33.57 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  31.77 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  31.99 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  30.23 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  30.47 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>