More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1670 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  100 
 
 
277 aa  556  1e-158  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  41.58 
 
 
279 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  38.41 
 
 
280 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  40.21 
 
 
283 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  38.79 
 
 
283 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  38.68 
 
 
314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  37.68 
 
 
280 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  37.59 
 
 
281 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  38.97 
 
 
279 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  38.6 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  38.6 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  38.6 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  38.6 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  41.01 
 
 
280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  41.01 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  39.19 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  36 
 
 
308 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  32.12 
 
 
308 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  34.53 
 
 
323 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  35.76 
 
 
293 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  35.14 
 
 
318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  34.16 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  34.42 
 
 
274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  33.81 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  33.71 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.62 
 
 
273 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  33.81 
 
 
311 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  34.52 
 
 
316 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  29.96 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  32.86 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  31.67 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  30.36 
 
 
285 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
272 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  29.6 
 
 
272 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  35.29 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  34.15 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  31.21 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  32.64 
 
 
299 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  33.22 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  33.82 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  35.11 
 
 
269 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  34.15 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  33.33 
 
 
319 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  32.65 
 
 
292 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  34.85 
 
 
304 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  31.56 
 
 
304 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  32.36 
 
 
320 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  30.85 
 
 
292 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  34.67 
 
 
276 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  33.58 
 
 
259 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  34.67 
 
 
276 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  35.02 
 
 
293 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  34.73 
 
 
269 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  32.25 
 
 
265 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  34.7 
 
 
288 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  31.02 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  31.14 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  31.03 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  29.64 
 
 
654 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  34.88 
 
 
308 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  30.74 
 
 
299 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  30.53 
 
 
292 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  32.12 
 
 
266 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  32.51 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  34.33 
 
 
314 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  32.97 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  32.97 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  30.77 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  32.12 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  29.37 
 
 
326 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  33.46 
 
 
269 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  30.77 
 
 
259 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  30.48 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  30.36 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  32.97 
 
 
281 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  30.55 
 
 
271 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  33.82 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  31.92 
 
 
266 aa  115  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  30.56 
 
 
307 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  33.1 
 
 
300 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  34.15 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  32.51 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  34.17 
 
 
291 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  34.64 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  33.84 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  31.5 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  30.74 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  34.72 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  33.45 
 
 
305 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  31.39 
 
 
264 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  31.21 
 
 
292 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  34.31 
 
 
268 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  31.93 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  35 
 
 
282 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  32.64 
 
 
292 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  31.9 
 
 
270 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 
278 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  31.56 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>