More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0362 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 273 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  78.87 
 
 		 273 aa  437  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  64.42 
 
 		 264 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  52.04 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  51.84 
 
 		 266 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  51.84 
 
 		 266 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  50.77 
 
 		 276 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  51.15 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  50.38 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  51.15 
 
 		 259 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  51.15 
 
 		 259 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  51.04 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  49.59 
 
 		 259 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  42.32 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  42.55 
 
 		 266 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  42.08 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  42.26 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  39.77 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  39.39 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  38.26 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  38.76 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  37.18 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  38.31 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  38.13 
 
 		 275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  38.04 
 
 		 274 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  37.93 
 
 		 296 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  37.02 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  36.96 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  37.23 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  38.49 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  39.21 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  38.81 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  36.82 
 
 		 274 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  36.94 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  36.82 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  37.31 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  36.4 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  36.46 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  38.02 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  36.23 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  36.68 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  35.59 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  36.84 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  34.94 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  34.72 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  34.44 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  35.85 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  34.5 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  33.58 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  33.81 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  34.73 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  34.59 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  33.45 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.75 
 
 		 280 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  30.8 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  31.39 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  31.64 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  32.75 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.45 
 
 		 326 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  31.75 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  30.69 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  30.8 
 
 		 319 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  30.74 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  30.6 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  31.88 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  31.29 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  31.72 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  30.69 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  30.72 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  31.83 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  32.03 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  29.51 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  32.25 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  28.82 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  31.16 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  30.98 
 
 		 300 aa  118  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  28.1 
 
 		 326 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  29.77 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  28.08 
 
 		 304 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  30.13 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  30.13 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  30.95 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  30.13 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  30.13 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  30.74 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  31.25 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  28.99 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  29.47 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  29.47 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  29.47 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  28.52 
 
 		 352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  29.33 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  32.62 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  28.77 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  30.07 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  28.43 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  28.43 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  31.65 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  29.69 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  31.52 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>