More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1429 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 265 aa  558  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  44.24 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  44.32 
 
 		 281 aa  234  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  42.49 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  41.03 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  41.11 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  40.73 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  42.7 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  42.75 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  39.5 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  38.7 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  38.7 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  37.22 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  38.87 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  36.78 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  39.85 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  39.46 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  38.76 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  36.5 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  39.46 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  36.5 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  38.35 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  36.19 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  38.29 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  37.08 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  38.02 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  36.09 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  35.82 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  34.44 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  34.8 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  34.8 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  35.53 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  34.2 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  34.33 
 
 		 265 aa  152  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  34.85 
 
 		 282 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  35.21 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  33.82 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  33.71 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  34.32 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  32.59 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  32.72 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  33.7 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  33.83 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 		 275 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  33.08 
 
 		 268 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 		 266 aa  139  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  30.9 
 
 		 326 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  33.71 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  31.1 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  30.99 
 
 		 283 aa  131  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  31.41 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  32.52 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  29.64 
 
 		 352 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  30.11 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  30.66 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  28.34 
 
 		 344 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  28.01 
 
 		 361 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  29.64 
 
 		 352 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  28.25 
 
 		 339 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  28.01 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  28.01 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  29.3 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  31.67 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  29.04 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  27.92 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  29.82 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  29.23 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  30.25 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  31.93 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  29.62 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  28.96 
 
 		 319 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  29.62 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  29.72 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  30.6 
 
 		 279 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  29.41 
 
 		 292 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  30.6 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  30.36 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  29.03 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  29.76 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  28.43 
 
 		 326 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  28.37 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  27.68 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  30.86 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  26.38 
 
 		 340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  29.11 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  29.08 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  27.65 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  29.29 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  29.18 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  30.71 
 
 		 292 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  30.47 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  26.06 
 
 		 350 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  26.06 
 
 		 340 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  31.79 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  28.77 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>