More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3168 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  100 
 
 
274 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  92.34 
 
 
274 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  66.3 
 
 
274 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  60.52 
 
 
272 aa  348  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  55.64 
 
 
278 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  53.61 
 
 
265 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  50.76 
 
 
265 aa  275  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  49.81 
 
 
270 aa  268  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  48.15 
 
 
273 aa  268  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  49.81 
 
 
267 aa  261  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  49.06 
 
 
266 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  43.48 
 
 
275 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  43.01 
 
 
279 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  41.57 
 
 
296 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  41.57 
 
 
286 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  42.18 
 
 
274 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  41.82 
 
 
274 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  37.12 
 
 
318 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  37.12 
 
 
318 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  37.12 
 
 
318 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  37.12 
 
 
318 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  37.12 
 
 
318 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  37.12 
 
 
318 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  37.12 
 
 
318 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  43.96 
 
 
273 aa  201  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  41.57 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  39.57 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  43.53 
 
 
269 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  36.45 
 
 
318 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  42.64 
 
 
268 aa  191  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  40.77 
 
 
278 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  42.75 
 
 
269 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  39.23 
 
 
282 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  42.23 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  40.07 
 
 
263 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  39.03 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  37.22 
 
 
275 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  39.16 
 
 
266 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  37.94 
 
 
273 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  38.16 
 
 
276 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  38.18 
 
 
265 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  38.02 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  37.46 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  39.6 
 
 
334 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  37.94 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  32.2 
 
 
329 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  39.6 
 
 
338 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  36.88 
 
 
269 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  36.19 
 
 
268 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
264 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  36.5 
 
 
266 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  36.13 
 
 
266 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 
316 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  31.9 
 
 
311 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  39.41 
 
 
335 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  39.41 
 
 
335 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  39.41 
 
 
335 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  35.45 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  35.07 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4109  transglutaminase domain-containing protein  42.08 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  31.79 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  35.74 
 
 
259 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  35.99 
 
 
292 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  36.46 
 
 
281 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  30.96 
 
 
318 aa  141  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  34.42 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  35.98 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  35.27 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  33.82 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  32.87 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  35.04 
 
 
272 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  32.97 
 
 
291 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  32.71 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  31.43 
 
 
308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  30.96 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  32.6 
 
 
272 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  33.82 
 
 
272 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  31.43 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  32.99 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  33.1 
 
 
293 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  29.97 
 
 
316 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  30.47 
 
 
273 aa  125  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  31.32 
 
 
654 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.14 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  29.11 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  29.9 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  29.9 
 
 
296 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  29.56 
 
 
271 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  29.35 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  28.62 
 
 
300 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  29.39 
 
 
296 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  28.62 
 
 
326 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  29.14 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  31.49 
 
 
299 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  27.74 
 
 
319 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  29.37 
 
 
307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>