269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4004 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  97.04 
 
 
338 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  89.85 
 
 
329 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  88.36 
 
 
335 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  88.36 
 
 
335 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  88.06 
 
 
335 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4109  transglutaminase domain-containing protein  80.24 
 
 
331 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  65.27 
 
 
318 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  65.27 
 
 
318 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  65.27 
 
 
318 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  65.27 
 
 
318 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  65.27 
 
 
318 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  65.57 
 
 
318 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  65.27 
 
 
318 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  65.57 
 
 
318 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  39.24 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  40.1 
 
 
274 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  44.06 
 
 
272 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  39.6 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  40.1 
 
 
274 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  42.08 
 
 
270 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  36.63 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  39.49 
 
 
265 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  41.29 
 
 
266 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  41.12 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  37.62 
 
 
273 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  30.79 
 
 
289 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  34.98 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  32.82 
 
 
273 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  37.56 
 
 
269 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
275 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  39.39 
 
 
268 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  33.67 
 
 
273 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  32.99 
 
 
274 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  36.55 
 
 
268 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  37.56 
 
 
269 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  34.52 
 
 
265 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  32.49 
 
 
264 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  31.98 
 
 
274 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  32.84 
 
 
287 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  31 
 
 
279 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  36 
 
 
273 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  33 
 
 
286 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  33 
 
 
296 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  35.9 
 
 
266 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  27.65 
 
 
275 aa  99.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  35.2 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  33.67 
 
 
263 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  35.38 
 
 
266 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  36.23 
 
 
282 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  31.28 
 
 
259 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  37.37 
 
 
278 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  31.98 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  31.47 
 
 
276 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  23.34 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  31.79 
 
 
259 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  30.96 
 
 
276 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  34.36 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  28.64 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  31.28 
 
 
266 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  31.13 
 
 
291 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  30.77 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  26.93 
 
 
281 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  31.73 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  30.26 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  30.26 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  32.2 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  27.92 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  32.18 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  27.7 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  26.42 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  24.18 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  30.81 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  27.14 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  27.8 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  22.77 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  24.15 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  27.36 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3512  transglutaminase domain protein  24.09 
 
 
1141 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  22.78 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  23.08 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  28.76 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  20.36 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  21.78 
 
 
272 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  26.5 
 
 
273 aa  63.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  29.91 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  24 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  29.91 
 
 
350 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  29.91 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  27.4 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  24.77 
 
 
277 aa  61.2  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  24.32 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  27.31 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22850  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.74 
 
 
259 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  29.46 
 
 
340 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  23.85 
 
 
292 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  29.46 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  29.46 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  29.46 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  27.56 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>