More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2773 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  57.89 
 
 
278 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  53.18 
 
 
265 aa  285  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  52.75 
 
 
273 aa  280  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  50 
 
 
274 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  53.67 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  50.75 
 
 
266 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  49.81 
 
 
274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  48.15 
 
 
272 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  44.91 
 
 
265 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  47.17 
 
 
274 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  42.46 
 
 
269 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  36.91 
 
 
318 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  36.91 
 
 
318 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  36.91 
 
 
318 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  36.91 
 
 
318 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  36.91 
 
 
318 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  36.91 
 
 
318 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  36.91 
 
 
318 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  38.13 
 
 
318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  42.46 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  42.23 
 
 
268 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  40.89 
 
 
275 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  39.18 
 
 
279 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  40.6 
 
 
268 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  40.3 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  39.41 
 
 
286 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  38.81 
 
 
296 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  39.19 
 
 
273 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  40 
 
 
274 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  38.81 
 
 
266 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  38.6 
 
 
287 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  36.7 
 
 
268 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  39.48 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  38.75 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  37.69 
 
 
266 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  42.08 
 
 
334 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  42.08 
 
 
338 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  35.91 
 
 
273 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  39.85 
 
 
275 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  39 
 
 
282 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  41.38 
 
 
329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  34.2 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  37.77 
 
 
266 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 
264 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  36.33 
 
 
265 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  42.36 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  42.36 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  42.36 
 
 
335 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  36.46 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  38.61 
 
 
278 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  35.93 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  33.71 
 
 
276 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35.94 
 
 
311 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  33.71 
 
 
276 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 
273 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  34.98 
 
 
269 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  33.08 
 
 
259 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  33.08 
 
 
259 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4109  transglutaminase domain-containing protein  44.62 
 
 
331 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 
326 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  34.05 
 
 
275 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  31.23 
 
 
318 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
272 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 
259 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  34.16 
 
 
316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  33.09 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  32.3 
 
 
308 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  34.26 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  34.25 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  33.58 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  29.64 
 
 
323 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  32.1 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  34.17 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  34.17 
 
 
272 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  34.04 
 
 
273 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 
273 aa  123  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  30.4 
 
 
272 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  32.51 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.77 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  32.57 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  32.57 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  32.25 
 
 
340 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  32.25 
 
 
338 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  29.67 
 
 
326 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  32.25 
 
 
338 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  32.25 
 
 
338 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  31.9 
 
 
277 aa  112  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  32.25 
 
 
340 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  29.53 
 
 
316 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  28.36 
 
 
654 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  31.6 
 
 
345 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  26.18 
 
 
308 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  30.57 
 
 
289 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  32.63 
 
 
293 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3585  transglutaminase-like  29.82 
 
 
1128 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.222679  normal  0.726735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  31.64 
 
 
288 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1712  transglutaminase-like  27.84 
 
 
1114 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.347512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  28.73 
 
 
1081 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  29.05 
 
 
295 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>