More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1085 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  100 
 
 
291 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  75.7 
 
 
293 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  61.67 
 
 
292 aa  343  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  61.37 
 
 
281 aa  338  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  59.93 
 
 
281 aa  328  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  43.4 
 
 
273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  40.73 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  41.28 
 
 
272 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  42.91 
 
 
266 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  41.39 
 
 
268 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  39.42 
 
 
259 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  39.05 
 
 
259 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  40.73 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  38.27 
 
 
269 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  39.05 
 
 
266 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  38.32 
 
 
263 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  39.42 
 
 
259 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  38.29 
 
 
264 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  38.13 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  38.32 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  39.13 
 
 
259 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  36.33 
 
 
276 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  35.97 
 
 
276 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  36.94 
 
 
273 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  36.04 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  36.04 
 
 
296 aa  162  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  37.68 
 
 
273 aa  161  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  35.44 
 
 
287 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  37.45 
 
 
282 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  38.04 
 
 
272 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  36.92 
 
 
266 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  34.55 
 
 
278 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  38.63 
 
 
265 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  35.4 
 
 
278 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  36.07 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  35.13 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  36.76 
 
 
269 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  34.41 
 
 
274 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  32.97 
 
 
274 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  35.48 
 
 
274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  35.13 
 
 
274 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  32.73 
 
 
274 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  34.95 
 
 
282 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.67 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  35.94 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  34.04 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  32.5 
 
 
272 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.14 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  32.97 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  33.58 
 
 
270 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  29.25 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  31.8 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  30.82 
 
 
272 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  31.36 
 
 
272 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.45 
 
 
326 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  35.66 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  35.27 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  33.79 
 
 
292 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  34.41 
 
 
268 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  30.14 
 
 
295 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 
316 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.36 
 
 
272 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  31.39 
 
 
352 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  35.07 
 
 
268 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  32.33 
 
 
319 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  32.81 
 
 
345 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  31.6 
 
 
296 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  33.45 
 
 
267 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  34.88 
 
 
273 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  31.72 
 
 
366 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  31.72 
 
 
367 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  31.25 
 
 
296 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  31.01 
 
 
361 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  32.03 
 
 
344 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.54 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  29.19 
 
 
291 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  31.07 
 
 
352 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  31.25 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  32.88 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  32.64 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  32.81 
 
 
350 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  32.11 
 
 
305 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  31.36 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
340 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
340 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  31.75 
 
 
339 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  34.17 
 
 
277 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  30.69 
 
 
323 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  32.9 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  32.9 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  32.9 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  32.9 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  32.99 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  32.08 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  32.45 
 
 
298 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  31.96 
 
 
319 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  31.44 
 
 
305 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  31.44 
 
 
305 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  32.91 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  29.45 
 
 
304 aa  112  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>