More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2116 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  100 
 
 		 265 aa  544  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  55.26 
 
 		 278 aa  310  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  55.31 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  54.14 
 
 		 266 aa  288  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  53.18 
 
 		 270 aa  285  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  51.15 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  50.76 
 
 		 274 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  52.51 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  49.43 
 
 		 272 aa  261  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  48.11 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  46.42 
 
 		 265 aa  251  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  44.53 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  44.24 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  41.13 
 
 		 273 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  43.01 
 
 		 279 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  42.08 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  41.04 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  41.7 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  40.22 
 
 		 274 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  42.08 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  39.55 
 
 		 286 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  39.55 
 
 		 296 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  36.28 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  36.28 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  36.28 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  36.28 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  36.28 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  36.28 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  36.28 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  39.62 
 
 		 273 aa  175  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  36.76 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  39.03 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  37.17 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  38.49 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  39.53 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  38.01 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  38.35 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  38.06 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  34.83 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  37.69 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  36.9 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  36.9 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  37.07 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  36.94 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  36.57 
 
 		 266 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  38.22 
 
 		 278 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  35.47 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  34.33 
 
 		 265 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  35.07 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 316 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  33.7 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  33.7 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  34.6 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  39.49 
 
 		 334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  39.49 
 
 		 338 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  29.93 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  35.34 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  35.21 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  38.78 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  30.77 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  33.81 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  34.66 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  39.8 
 
 		 335 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  39.8 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  39.8 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  30.42 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  34.04 
 
 		 292 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  32.97 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 		 272 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  29.51 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  31.56 
 
 		 654 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  31.91 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4109  transglutaminase domain-containing protein  41.54 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  33.93 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  29.6 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  31.4 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  43.07 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  32.75 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  29.2 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  30.6 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3645  transglutaminase domain protein  26.9 
 
 		 1108 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3343  transglutaminase domain protein  27.24 
 
 		 1108 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  28.72 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  29.04 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  29.04 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  28.12 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2637  transglutaminase domain-containing protein  28.96 
 
 		 1091 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0330314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  32.32 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3752  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1114 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139209  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  28.52 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  31.32 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  26.35 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  27.24 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3017  transglutaminase domain-containing protein  28.41 
 
 		 1127 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0756013  normal  0.525776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2614  transglutaminase domain-containing protein  28.21 
 
 		 1107 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.95635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  30.74 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>