More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3574 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  96.99 
 
 
266 aa  527  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  76.32 
 
 
265 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  73.23 
 
 
269 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  68.48 
 
 
276 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  68.48 
 
 
276 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  66.8 
 
 
259 aa  348  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  66.41 
 
 
259 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  66.8 
 
 
259 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  66.02 
 
 
259 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  54.58 
 
 
264 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  51.92 
 
 
273 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  52.87 
 
 
273 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  48.51 
 
 
263 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  44.91 
 
 
266 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  44.32 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  43.17 
 
 
274 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  42.31 
 
 
286 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  42.31 
 
 
296 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  41.33 
 
 
281 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  41.11 
 
 
292 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  41.76 
 
 
287 aa  191  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  45.17 
 
 
278 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  39.85 
 
 
265 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  41.85 
 
 
281 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  42.39 
 
 
275 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  42.09 
 
 
274 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  42.64 
 
 
268 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  44.4 
 
 
282 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  39.85 
 
 
279 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  41.09 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  39.05 
 
 
291 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  39.63 
 
 
273 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  38.32 
 
 
278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  40.6 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  39.16 
 
 
274 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  38.66 
 
 
272 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  38.02 
 
 
274 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  39.92 
 
 
269 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  40.23 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  37.64 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  37.94 
 
 
293 aa  161  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  38.27 
 
 
272 aa  161  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  39.92 
 
 
269 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  39.1 
 
 
268 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  36.94 
 
 
265 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  40.08 
 
 
268 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  40.15 
 
 
266 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  37.77 
 
 
270 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  37.4 
 
 
267 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  36.73 
 
 
280 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  37.88 
 
 
274 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  36.16 
 
 
273 aa  148  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  32.85 
 
 
280 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  36.52 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  34.28 
 
 
304 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  35.87 
 
 
271 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
299 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  34.3 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  35.61 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.44 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  31.6 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  31.08 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  31.08 
 
 
352 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  36.61 
 
 
294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  30.74 
 
 
366 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  30.74 
 
 
367 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  30.94 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  30.94 
 
 
340 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  30.07 
 
 
344 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  30.41 
 
 
361 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.45 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  30.87 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  30.62 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  30.62 
 
 
338 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  30.62 
 
 
338 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  30.62 
 
 
338 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  34.19 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  34.81 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  33.46 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  31.01 
 
 
304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  33.1 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  32.59 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  31.06 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  35.52 
 
 
289 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  32.64 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  34.3 
 
 
320 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  29.96 
 
 
279 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  29.96 
 
 
279 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  30.82 
 
 
283 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  29.96 
 
 
279 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 
311 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  32.48 
 
 
275 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  32.52 
 
 
299 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  29.32 
 
 
339 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  32.29 
 
 
292 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  31.94 
 
 
296 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  33.09 
 
 
273 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  29.97 
 
 
332 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>