More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0543 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  100 
 
 		 296 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  85.08 
 
 		 297 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  84.75 
 
 		 297 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  75.51 
 
 		 297 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  74.15 
 
 		 304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  71.43 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  71.86 
 
 		 311 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  56.57 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  55 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  48.3 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  49.32 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  46.92 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  47.49 
 
 		 316 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  45.36 
 
 		 296 aa  258  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  45 
 
 		 326 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  46.05 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  48.28 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  45.91 
 
 		 303 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  44.48 
 
 		 293 aa  252  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  41.18 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  42.44 
 
 		 417 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  42.96 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  44.07 
 
 		 319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  43.45 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  45.08 
 
 		 330 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  43.58 
 
 		 292 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  42.81 
 
 		 344 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  42.44 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  42.57 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  42.66 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  42.49 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  42.12 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  44.03 
 
 		 292 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  44.71 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  44.22 
 
 		 292 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  42.17 
 
 		 366 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  42.17 
 
 		 367 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  42.35 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  41.9 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  41.9 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  41.59 
 
 		 345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  41.9 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  41.9 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  41.9 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  41.9 
 
 		 350 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  41.9 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  43.1 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  41.92 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  39.59 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  40.94 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  41.98 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  42.86 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  40.89 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  41.78 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  41.43 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  41.95 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  41.16 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  40.2 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  40.89 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  40.6 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  39.12 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  37.84 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  37.84 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  38.13 
 
 		 310 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  38.54 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  36.95 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  38.91 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  41.84 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  37.37 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  36.93 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  35.96 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  36.49 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  35.81 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  38.8 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  36.24 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  34.12 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2612  transglutaminase domain-containing protein  35.25 
 
 		 294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0952  transglutaminase-like protein  34.58 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3019  transglutaminase domain-containing protein  35.91 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.798249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  33.68 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.38 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  35.35 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  30.43 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  35.27 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.65 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  33.1 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5604  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.639349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  33.1 
 
 		 266 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  31.72 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  32.41 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  33.67 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  32.77 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  29.41 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  30.54 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0967  transglutaminase-like  29.72 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  hitchhiker  0.00428968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  31.76 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>