More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2249 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  100 
 
 
300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  41.2 
 
 
304 aa  258  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  47.35 
 
 
300 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  42.91 
 
 
292 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  44.18 
 
 
297 aa  245  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  42.96 
 
 
293 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  46.21 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  46.93 
 
 
292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  40.75 
 
 
292 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  46.84 
 
 
299 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  46.51 
 
 
300 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  44.22 
 
 
311 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  44.85 
 
 
299 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  40.88 
 
 
292 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  44.22 
 
 
304 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  44.41 
 
 
299 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  42.52 
 
 
311 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  44.22 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  43.52 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  45.05 
 
 
304 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  40.54 
 
 
292 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  40.75 
 
 
297 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  39.73 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  40.74 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  39.93 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  40.07 
 
 
297 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  42.61 
 
 
294 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  38.13 
 
 
319 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  39.59 
 
 
296 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  40.75 
 
 
295 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  38.19 
 
 
307 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  47.33 
 
 
298 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  43.29 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  39.66 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  39.2 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  42.58 
 
 
338 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  42.58 
 
 
338 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  42.44 
 
 
340 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  42.58 
 
 
338 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  42.44 
 
 
340 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  36.27 
 
 
291 aa  208  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  42.58 
 
 
350 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  42.44 
 
 
340 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  42.31 
 
 
352 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  42.58 
 
 
366 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  42.58 
 
 
367 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  38.89 
 
 
316 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  41.99 
 
 
352 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  42.07 
 
 
361 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  41.94 
 
 
344 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  40.28 
 
 
296 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  39.52 
 
 
296 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  41.61 
 
 
345 aa  201  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  41.72 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  39.38 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  40.07 
 
 
303 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  40.94 
 
 
300 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  42.2 
 
 
314 aa  199  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  41.78 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  39.04 
 
 
296 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  39.59 
 
 
310 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  38.91 
 
 
310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  36.1 
 
 
330 aa  188  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  35.94 
 
 
417 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3019  transglutaminase domain-containing protein  37.63 
 
 
293 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.798249  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  37.2 
 
 
304 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  38.18 
 
 
305 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  37.84 
 
 
305 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  38.18 
 
 
305 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  40.38 
 
 
339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  36.95 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2612  transglutaminase domain-containing protein  37.29 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0952  transglutaminase-like protein  36.95 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  35.25 
 
 
292 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  36.77 
 
 
300 aa  175  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 
292 aa  175  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  36.52 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  37.34 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  34.58 
 
 
292 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  35.05 
 
 
292 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  34.56 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  35.96 
 
 
308 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  30.2 
 
 
308 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.03 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  37.46 
 
 
280 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  32.87 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  34.6 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  34.62 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  32.42 
 
 
283 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.45 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  32.65 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 
316 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  32.4 
 
 
283 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  29.51 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  31.14 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>