More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3407 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 326 aa  666    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  58.47 
 
 		 316 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  59.63 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  54.72 
 
 		 307 aa  349  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  54.63 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  54.63 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  55.27 
 
 		 340 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  54.31 
 
 		 361 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  55.27 
 
 		 350 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  54.46 
 
 		 352 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  54.6 
 
 		 340 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  54.95 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  54.95 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  54.14 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  54.95 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  54.95 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  53.04 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  53.35 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  53.97 
 
 		 339 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  49.83 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  48.23 
 
 		 320 aa  272  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  48.31 
 
 		 296 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  47.97 
 
 		 296 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  45.87 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  44.75 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  47 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  46 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  45 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  46.71 
 
 		 311 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  46.53 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  46 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  46.31 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  46.36 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  46.33 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  46.34 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  45.39 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  44.63 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  39.62 
 
 		 304 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  44.04 
 
 		 292 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  44.41 
 
 		 303 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  41.33 
 
 		 292 aa  235  9e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  43.04 
 
 		 299 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  43.89 
 
 		 292 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  43.67 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  39.8 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  37.54 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  48.69 
 
 		 417 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  42.19 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  40.6 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  42.95 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  42.33 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  40.92 
 
 		 305 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  40.92 
 
 		 305 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  40.92 
 
 		 305 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  41.86 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  39.2 
 
 		 300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  39.93 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  41.61 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  39.67 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  41.55 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  41.58 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  40.97 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  40.28 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  41.33 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  41.12 
 
 		 300 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  38.74 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  42.18 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  40.79 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  40.74 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  40.6 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  35.67 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  38.54 
 
 		 292 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  36.96 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  37.87 
 
 		 292 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  40.73 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  36.3 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0952  transglutaminase-like protein  37.25 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2612  transglutaminase domain-containing protein  36.75 
 
 		 294 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3019  transglutaminase domain-containing protein  37.42 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.798249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  37.67 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  36.12 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  37.13 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  36.84 
 
 		 272 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35.81 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  33.12 
 
 		 654 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  35.93 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  34.12 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  35.86 
 
 		 272 aa  149  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  34.54 
 
 		 271 aa  149  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  35.47 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  33.11 
 
 		 280 aa  146  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  35.2 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  31.23 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  36.45 
 
 		 285 aa  143  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  33.11 
 
 		 279 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  32.55 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  36.16 
 
 		 272 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  30.27 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  34.9 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>