More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3181 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  100 
 
 
280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  75 
 
 
280 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  69.42 
 
 
279 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  69.42 
 
 
279 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  69.42 
 
 
279 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  69.06 
 
 
279 aa  401  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  69.06 
 
 
279 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  62.59 
 
 
279 aa  364  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  59.29 
 
 
280 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  50.53 
 
 
281 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  49.46 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  50.72 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  46.26 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  45.2 
 
 
283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  44.63 
 
 
314 aa  238  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  38.41 
 
 
277 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  33.94 
 
 
323 aa  175  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  35.34 
 
 
326 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.64 
 
 
311 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  33.57 
 
 
308 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  34.29 
 
 
318 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  32.65 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  33.21 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  34.62 
 
 
285 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  35.69 
 
 
273 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  36.43 
 
 
293 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
272 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  33.92 
 
 
272 aa  158  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  32.99 
 
 
272 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  37.41 
 
 
340 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  33.1 
 
 
272 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  37.29 
 
 
345 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  37.41 
 
 
350 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  37.41 
 
 
340 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  34.72 
 
 
292 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  36.39 
 
 
352 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  37.07 
 
 
338 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  37.07 
 
 
340 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  37.07 
 
 
338 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  37.07 
 
 
338 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  36.07 
 
 
271 aa  155  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  36.39 
 
 
352 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  35.2 
 
 
367 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  36.18 
 
 
319 aa  152  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  35.2 
 
 
366 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  32.76 
 
 
292 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  31.83 
 
 
299 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  33.22 
 
 
316 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  35.2 
 
 
361 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  34.21 
 
 
344 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  32.99 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  35.64 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  36.82 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  33.21 
 
 
266 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  33.11 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  31.65 
 
 
293 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  33.56 
 
 
320 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  32.51 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  31.69 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  35.37 
 
 
304 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  32.04 
 
 
292 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  32.85 
 
 
266 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  32.53 
 
 
295 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  34.2 
 
 
339 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  32.75 
 
 
292 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  32.76 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  32.01 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  32.4 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  34.6 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  32.21 
 
 
299 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  31.13 
 
 
307 aa  138  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  32.01 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  31.29 
 
 
292 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  31.88 
 
 
269 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  31.44 
 
 
330 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  31.44 
 
 
297 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
310 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  30.41 
 
 
654 aa  135  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  31.31 
 
 
297 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  34.48 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  33 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  31.65 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  32.21 
 
 
304 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  36.43 
 
 
282 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  32.01 
 
 
265 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  32.18 
 
 
310 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  32.22 
 
 
292 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  31.03 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  31.36 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  30.48 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  31.75 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  31.77 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  32.37 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  32.44 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  32.06 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  31.43 
 
 
292 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  31.48 
 
 
292 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 
264 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  32.36 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  34.49 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>