More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2048 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  100 
 
 
654 aa  1348    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  34.94 
 
 
323 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  32.67 
 
 
308 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.25 
 
 
311 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  33.12 
 
 
326 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  34.95 
 
 
330 aa  151  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  34.44 
 
 
316 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.65 
 
 
326 aa  150  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  34.75 
 
 
316 aa  147  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  30.45 
 
 
308 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 
320 aa  140  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  34.38 
 
 
332 aa  140  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  33.55 
 
 
340 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  33.68 
 
 
280 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
350 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  34.28 
 
 
352 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
340 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
338 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
338 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
338 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
340 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  32.57 
 
 
345 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  33.77 
 
 
304 aa  137  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  33.87 
 
 
344 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 
361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  30.41 
 
 
280 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  34.19 
 
 
366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  34.19 
 
 
367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  36.09 
 
 
293 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 
310 aa  135  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  32.29 
 
 
316 aa  134  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  30.45 
 
 
317 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
299 aa  132  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  34.27 
 
 
292 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  32.66 
 
 
296 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  32.24 
 
 
305 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
339 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  33.89 
 
 
319 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  30.34 
 
 
291 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  32.24 
 
 
305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  32.24 
 
 
305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  30.53 
 
 
318 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  31.45 
 
 
297 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 
293 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  30.51 
 
 
292 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  29.51 
 
 
279 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  33.57 
 
 
292 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
310 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  32.04 
 
 
288 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  30.92 
 
 
296 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  33.22 
 
 
308 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  32.33 
 
 
319 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  31.45 
 
 
292 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  29.63 
 
 
280 aa  125  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  31.56 
 
 
274 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  32.39 
 
 
274 aa  125  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  34.3 
 
 
300 aa  124  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  31.56 
 
 
265 aa  124  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  33.01 
 
 
299 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  31.76 
 
 
303 aa  124  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4135  transglutaminase-like  31.94 
 
 
304 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  30.93 
 
 
292 aa  124  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  123  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3978  transglutaminase-like  33.01 
 
 
304 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  31.14 
 
 
271 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  31.36 
 
 
273 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  29.51 
 
 
272 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  29.79 
 
 
313 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  31.99 
 
 
304 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  31.08 
 
 
296 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  32.32 
 
 
292 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 
266 aa  122  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  31.6 
 
 
300 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  28.77 
 
 
279 aa  122  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  27.21 
 
 
266 aa  121  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  30.88 
 
 
287 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  30.56 
 
 
299 aa  121  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  29.97 
 
 
297 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  31.7 
 
 
295 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  32.04 
 
 
274 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1061  transglutaminase domain-containing protein  28.83 
 
 
314 aa  120  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  30.56 
 
 
297 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  30.82 
 
 
281 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  30.22 
 
 
307 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  29.82 
 
 
296 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  29.64 
 
 
277 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  29.58 
 
 
279 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3019  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 
293 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.798249  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  31.56 
 
 
274 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  31.23 
 
 
286 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  31.77 
 
 
292 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  31.79 
 
 
292 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  29.82 
 
 
283 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  32.05 
 
 
257 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  32.34 
 
 
304 aa  118  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  32.05 
 
 
257 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1611  transglutaminase domain protein  28.46 
 
 
305 aa  118  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  30.86 
 
 
261 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  29.86 
 
 
283 aa  117  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>