More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2100 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
281 aa  569  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  56.07 
 
 
280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  50.53 
 
 
280 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  50.18 
 
 
279 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  50.71 
 
 
280 aa  286  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  50.54 
 
 
279 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  50.54 
 
 
279 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  50.54 
 
 
279 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  49.82 
 
 
279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  50 
 
 
279 aa  271  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  49.28 
 
 
279 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  44.68 
 
 
283 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  45.39 
 
 
283 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  45.29 
 
 
279 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  41.98 
 
 
314 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  37.96 
 
 
277 aa  181  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  38.49 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  36.69 
 
 
323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  37.1 
 
 
326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  35.79 
 
 
292 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  37.1 
 
 
311 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  34.41 
 
 
318 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  32.74 
 
 
308 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  36.17 
 
 
271 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  34.25 
 
 
272 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.98 
 
 
273 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  35.99 
 
 
299 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  30.18 
 
 
272 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  35.39 
 
 
292 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  30.39 
 
 
285 aa  142  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  31.47 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  36.73 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  35.57 
 
 
326 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  35.15 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
295 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  35.59 
 
 
330 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  35.86 
 
 
281 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  35.92 
 
 
316 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  31.91 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  33.23 
 
 
316 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  35.62 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  32.42 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  35.09 
 
 
292 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.45 
 
 
272 aa  133  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 
281 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  33.67 
 
 
292 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  34.41 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  35.86 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  32.08 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  34.24 
 
 
319 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  34.19 
 
 
340 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  30.58 
 
 
291 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  34.19 
 
 
350 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  32.51 
 
 
292 aa  128  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  34.19 
 
 
340 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  31.8 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  34.19 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  34.19 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  33.87 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  33.87 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  33.87 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  34.39 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  33.87 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  32.42 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  31.45 
 
 
259 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  33.77 
 
 
305 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  33.23 
 
 
352 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  34.85 
 
 
304 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  31.29 
 
 
654 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  31.71 
 
 
288 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  33.79 
 
 
308 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  33.89 
 
 
310 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  31.94 
 
 
292 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  33.77 
 
 
305 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  33.77 
 
 
305 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  30.8 
 
 
266 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  34.01 
 
 
316 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  30.43 
 
 
266 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  31.76 
 
 
314 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  33.23 
 
 
344 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  32.91 
 
 
352 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  33.1 
 
 
266 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  32.4 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  30.42 
 
 
292 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  30.14 
 
 
299 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 
297 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  31.47 
 
 
265 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  32.87 
 
 
310 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  33.33 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  33.67 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  32.39 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  28.88 
 
 
266 aa  119  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  31.42 
 
 
300 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  30.51 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  32.09 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  30.14 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  32.75 
 
 
268 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  32.75 
 
 
291 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  30.41 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>