More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1062 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  91.81 
 
 		 281 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  85.2 
 
 		 292 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  61.37 
 
 		 291 aa  338  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  58.1 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  47.87 
 
 		 273 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  45.71 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  44.32 
 
 		 265 aa  234  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  42.22 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  41.85 
 
 		 259 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  41.54 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  42.49 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  41.24 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  41.76 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  39.01 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  41.33 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  39.78 
 
 		 276 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  39.05 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  40.91 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  39.39 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  39.42 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  40.59 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  41.48 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  41.67 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  40.29 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  38.83 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  41.11 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  42.03 
 
 		 274 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  38.99 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  38.63 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  41.88 
 
 		 275 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  39.15 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  37.1 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  35.31 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  36.46 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  38.63 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  35.87 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  38.79 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  35.69 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  36.1 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  35.22 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35.55 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 		 268 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  35.29 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  35.69 
 
 		 278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  35.27 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  36.43 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.97 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 		 274 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  32.87 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  32.18 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  37.81 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  34.66 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  34.25 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  35.19 
 
 		 269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  33.66 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  35.14 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  32.53 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  33.94 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  34.8 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  31.36 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  32.32 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  31.08 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  34.88 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  32.29 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  32.99 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  34.01 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  29.69 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  35.86 
 
 		 281 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  31.62 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  31.92 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  32.32 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  32.09 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  32.29 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  33.89 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  31.6 
 
 		 366 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  31.6 
 
 		 367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  32.07 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  30.82 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  30.43 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  33.44 
 
 		 345 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  31.27 
 
 		 361 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  31.27 
 
 		 352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  28.86 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  31.72 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  29.51 
 
 		 307 aa  118  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  32.24 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  35.03 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  31.21 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  33.44 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  35.15 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.29 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  33.44 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>