More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1080 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
269 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  99.63 
 
 
269 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  88.42 
 
 
268 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  63.94 
 
 
268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  44.61 
 
 
272 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  41.73 
 
 
278 aa  208  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  43.33 
 
 
296 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  43.49 
 
 
286 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  43.17 
 
 
287 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  42.64 
 
 
274 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  42.64 
 
 
274 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  42.26 
 
 
270 aa  195  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  42.11 
 
 
275 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  42.42 
 
 
265 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  40 
 
 
274 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  45.82 
 
 
273 aa  191  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  39.62 
 
 
274 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  39.47 
 
 
279 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  41.26 
 
 
274 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  41.57 
 
 
266 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  42.34 
 
 
273 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  40.89 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  43.45 
 
 
275 aa  178  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  40.38 
 
 
267 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  43.46 
 
 
278 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  39.03 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  39.85 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  39.85 
 
 
266 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  42.31 
 
 
282 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  37.27 
 
 
275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  35.61 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  38.2 
 
 
269 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  38.2 
 
 
259 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  38.2 
 
 
259 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.92 
 
 
326 aa  158  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  35.02 
 
 
273 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  34.18 
 
 
285 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  36.53 
 
 
292 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  36.92 
 
 
268 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  35.65 
 
 
318 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  35.65 
 
 
318 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  35.65 
 
 
318 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  35.65 
 
 
318 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  35.65 
 
 
318 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  35.65 
 
 
318 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  35.65 
 
 
318 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  35.47 
 
 
273 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  35.96 
 
 
276 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.27 
 
 
311 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  32.85 
 
 
272 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  37.17 
 
 
266 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  35.69 
 
 
276 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  33.7 
 
 
273 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  36.59 
 
 
266 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  34.8 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  33.94 
 
 
272 aa  145  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  34.89 
 
 
281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  38.49 
 
 
259 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  36.79 
 
 
291 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  37.69 
 
 
259 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  33.23 
 
 
318 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  34.42 
 
 
281 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  36.9 
 
 
263 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  34.55 
 
 
272 aa  141  9e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 
316 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  32.27 
 
 
318 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  35.61 
 
 
273 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 
308 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  29.82 
 
 
308 aa  131  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  35.9 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  31.25 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  34.95 
 
 
293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  34.18 
 
 
279 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  31.18 
 
 
289 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  32.42 
 
 
299 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  32.23 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  32.97 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  31 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  32.97 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  32.97 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  30.4 
 
 
279 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  34.03 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  32.64 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  31.29 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  32.08 
 
 
332 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  30.36 
 
 
279 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.02 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  30.92 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  29.96 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  30.94 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  37.56 
 
 
334 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  41.07 
 
 
344 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  37.56 
 
 
338 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  32.88 
 
 
311 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  29.83 
 
 
296 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>