More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4480 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  60.89 
 
 		 274 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  61.4 
 
 		 274 aa  348  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  60.52 
 
 		 274 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  54.95 
 
 		 278 aa  311  9e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  58.17 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  48.15 
 
 		 270 aa  265  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  49.43 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  47.99 
 
 		 273 aa  258  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  48.5 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  48.08 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  46.12 
 
 		 268 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  45.17 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  47.39 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  45.17 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  38.1 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  38.1 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  38.1 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  38.1 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  38.1 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  38.1 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  38.1 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  43.96 
 
 		 273 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  42.03 
 
 		 275 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  41.04 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  41.04 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  37.78 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  40.14 
 
 		 279 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  40.52 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  41.85 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  40.73 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  40.58 
 
 		 274 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  36.19 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  39.63 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  38.49 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  44.06 
 
 		 334 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  39.57 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  38.13 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  40.15 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  39 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  43.56 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  37.97 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  37.26 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  36.68 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  38.27 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  35.9 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  36.63 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  37.12 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  36.53 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  42.36 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  37.91 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  42.36 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  42.36 
 
 		 329 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  42.36 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  39.49 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  36.74 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  37.68 
 
 		 292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  38.04 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  36.88 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  36.09 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  38.04 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  36.23 
 
 		 281 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  35.87 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4109  transglutaminase domain-containing protein  43.35 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.44 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  34.91 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  33.09 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  31.54 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.21 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 		 352 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  31.72 
 
 		 326 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  32.24 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  30.71 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  31.97 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  32.34 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  33.01 
 
 		 361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  33.77 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  33.01 
 
 		 344 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  32.68 
 
 		 366 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  32.68 
 
 		 367 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  31.4 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  29.64 
 
 		 308 aa  128  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  30.6 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  31.96 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  32.9 
 
 		 350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  32.9 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  30.95 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  33.44 
 
 		 299 aa  125  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  32.9 
 
 		 340 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  30.14 
 
 		 293 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 		 339 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  32.57 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  33.92 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  32.57 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>