More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1942 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  46.44 
 
 		 286 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  46.72 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  45.45 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  47.57 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  46.07 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  45.99 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  45.99 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  44.73 
 
 		 278 aa  222  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  42.86 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  46.72 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  43.96 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  43.96 
 
 		 274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  45.66 
 
 		 265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  43.96 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  45 
 
 		 278 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  43.08 
 
 		 282 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  46.01 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  41.13 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  43.23 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  43.23 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  42.75 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  43.85 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  41.09 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  41.51 
 
 		 264 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  45.59 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  41.45 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  40.98 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  41.51 
 
 		 265 aa  188  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  41.91 
 
 		 266 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  44.44 
 
 		 268 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  39.62 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  42.48 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  40.88 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  39.25 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  39.19 
 
 		 274 aa  184  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  39.19 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  39.55 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  39.15 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  41.76 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  40 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  38.55 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  41.73 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  36 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  39.25 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  36.1 
 
 		 281 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  35.13 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  35.34 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  36.04 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  36.15 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  31.9 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  33.44 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  33.44 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  33.44 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  33.44 
 
 		 318 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  33.44 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  33.44 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  33.44 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  32.03 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  32.45 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  30.47 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  33.44 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  32.25 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  33.21 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  32.1 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  32.1 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  32.1 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  34.49 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  30.63 
 
 		 272 aa  122  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.27 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  30.49 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  35.09 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 		 326 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  29.89 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  28.07 
 
 		 323 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  29.15 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  30.26 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  29.54 
 
 		 654 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  32.98 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  32.37 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  29.03 
 
 		 330 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  30.96 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  29.45 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  29.3 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  31.16 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  36 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22850  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.1 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  32.13 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  36 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  31.03 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  28.91 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  31.14 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  30.1 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  27.96 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>