More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3273 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  81.67 
 
 		 311 aa  535  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  60.27 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  63.57 
 
 		 308 aa  351  8.999999999999999e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  52.6 
 
 		 318 aa  332  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  51.06 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  40.85 
 
 		 273 aa  199  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  39.51 
 
 		 285 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  38.6 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  39.79 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  38.81 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  40.97 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  38.03 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  38.6 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  34.53 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  34.84 
 
 		 304 aa  172  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  37.33 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  35.4 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  37.93 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  38.44 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  33.93 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  36.24 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  35.71 
 
 		 279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  35.09 
 
 		 279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  35.71 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  38.99 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  34.04 
 
 		 279 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  37.11 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  36.86 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  34.44 
 
 		 654 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  38.85 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  37.54 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  36.58 
 
 		 319 aa  159  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  37.87 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  36.21 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  35.13 
 
 		 278 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  35.81 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  37.72 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  37.79 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  32.97 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  36.65 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  37.46 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  32.62 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  33.89 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  37.79 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  37.79 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  33.53 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  37.11 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  35.15 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  35.84 
 
 		 292 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  35.4 
 
 		 282 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  36.3 
 
 		 296 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  35.99 
 
 		 297 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  37.84 
 
 		 319 aa  149  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  36.03 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  36.61 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  33.22 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  35.88 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  34.62 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  36 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  37.83 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  34.52 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  33.69 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  35.96 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  33.69 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  35.25 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  35.62 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  33.69 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  34.35 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  35.4 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  33.68 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  37.85 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  34.33 
 
 		 292 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  32.98 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  34.52 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  35.67 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  34 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  35.95 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  33.68 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  30.82 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  34.02 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  35.76 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  35.76 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  36.03 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  34.08 
 
 		 361 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  35.76 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  34.08 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  32.01 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  34.08 
 
 		 366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  35.13 
 
 		 292 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.867984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>