More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2560 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  100 
 
 		 319 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  52.32 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  47.96 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  47.1 
 
 		 332 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  48.5 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  48.47 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  47.44 
 
 		 293 aa  258  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  46.51 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  49.33 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  46.31 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  45.78 
 
 		 366 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  45.78 
 
 		 367 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  45.95 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  45.34 
 
 		 361 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  43.96 
 
 		 297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  44.56 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  44.9 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  44.48 
 
 		 344 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  44.07 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  45.12 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  43.96 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  43.96 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  44.59 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  44.59 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  45.22 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  44.9 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  44.9 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  47.1 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  44.9 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  44.9 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  44.92 
 
 		 316 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  44.9 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  44.9 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  44.59 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  40.68 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  43.48 
 
 		 292 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  45.14 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  43.42 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  42.67 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  38.67 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  44.22 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  42.95 
 
 		 292 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  45.23 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  44.15 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  44.16 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  41.5 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  41.84 
 
 		 292 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  42.52 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  38.13 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  41.33 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  45.58 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  43.43 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  42.37 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  40.65 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  39.06 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  41.75 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  43.43 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  40.74 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  44.11 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  40.07 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  40.07 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  40.26 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  40.4 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  39.86 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  38.67 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  39.13 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  39.13 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  36.42 
 
 		 417 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  39.36 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  39.12 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  40.86 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  36.82 
 
 		 292 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  35.25 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  37.16 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  37.25 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  35.81 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  35.45 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  34.9 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35.86 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  34.47 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  35.17 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  34.14 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  34.72 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  36.18 
 
 		 280 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  31.31 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  31.96 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3019  transglutaminase domain-containing protein  34.22 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.798249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  35.49 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  34.83 
 
 		 279 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  34.83 
 
 		 279 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  34.83 
 
 		 279 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  35.49 
 
 		 279 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  36.77 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  34.55 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  35.86 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.99 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3862  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  33.91 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  35.4 
 
 		 280 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>