More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2498 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  100 
 
 		 330 aa  685    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  58.61 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  57.1 
 
 		 316 aa  352  5e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  52.13 
 
 		 307 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  52.73 
 
 		 345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  52.4 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  52.4 
 
 		 350 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  52.08 
 
 		 338 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  52.08 
 
 		 338 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  52.08 
 
 		 338 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  52.08 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  52.08 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  50.8 
 
 		 352 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  50.8 
 
 		 352 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  50.64 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  50.8 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  50.8 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  50.8 
 
 		 344 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  51.77 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  47.47 
 
 		 319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  48.65 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  47.97 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  44.97 
 
 		 296 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  46.71 
 
 		 303 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  47.85 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  46.96 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  45.08 
 
 		 296 aa  242  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  46.9 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  43.33 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  47.1 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  44.7 
 
 		 311 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  42.81 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  42.95 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  40.78 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  43.1 
 
 		 293 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  43 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  39.83 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  43.96 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  43.14 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  42.28 
 
 		 291 aa  225  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  42.23 
 
 		 292 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  43.1 
 
 		 299 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  39.35 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  40.27 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  40.71 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  41.2 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  41.36 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  42.55 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  41.67 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  42.07 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  40.6 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  40.8 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  38.03 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  40.74 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  41.08 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  40.77 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  39.6 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  39.93 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  39.27 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  39.27 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  40 
 
 		 300 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  39.22 
 
 		 299 aa  196  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  39.93 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  39.47 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  40.07 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  36.1 
 
 		 300 aa  189  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  40.27 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  38.01 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  39.86 
 
 		 298 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  32.57 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  38.82 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  37.97 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  34.78 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  36.24 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  35.88 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0855  transglutaminase domain protein  33.77 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21199  normal  0.166966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  34.35 
 
 		 654 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  36.09 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3019  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.798249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0952  transglutaminase-like protein  35.11 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  32.89 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2612  transglutaminase domain-containing protein  35.46 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  32.27 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  32.32 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  31.46 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.44 
 
 		 280 aa  139  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  32.58 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  33.11 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  33.55 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  31.58 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  34.09 
 
 		 272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  32.99 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  32.78 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>