More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3332 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  100 
 
 
300 aa  612  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  56.23 
 
 
305 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  56.23 
 
 
305 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  56.23 
 
 
305 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  57.58 
 
 
316 aa  316  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3769  transglutaminase domain-containing protein  55.86 
 
 
310 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2630  transglutaminase domain-containing protein  53.2 
 
 
310 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.23656  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1966  transglutaminase domain protein  53.26 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  53.36 
 
 
314 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  45.18 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  43.3 
 
 
293 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  43.6 
 
 
304 aa  238  8e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  45.15 
 
 
320 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  43.34 
 
 
292 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  40.2 
 
 
291 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  44.44 
 
 
316 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  44.18 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  41.59 
 
 
361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  44.56 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  43.1 
 
 
297 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  43.04 
 
 
338 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  43.04 
 
 
340 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  41.21 
 
 
366 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  43.04 
 
 
338 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  41.21 
 
 
367 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  43.04 
 
 
338 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  40.97 
 
 
352 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  42.72 
 
 
340 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  42.12 
 
 
339 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  42.72 
 
 
350 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  40.97 
 
 
352 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  42.72 
 
 
340 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  41.3 
 
 
295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  42.02 
 
 
345 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  39.74 
 
 
344 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  41.61 
 
 
326 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  41.69 
 
 
311 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  40.96 
 
 
297 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  41.5 
 
 
311 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  41.55 
 
 
297 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  41.16 
 
 
296 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07510  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  42.71 
 
 
339 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  41.67 
 
 
321 aa  201  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  43.54 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  38.98 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0727  transglutaminase family protein  40.96 
 
 
296 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  38.7 
 
 
292 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  39.93 
 
 
330 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  38.24 
 
 
307 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  40.27 
 
 
296 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  39.25 
 
 
296 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  40 
 
 
303 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  39.36 
 
 
319 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  39.04 
 
 
292 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  39.8 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  37.76 
 
 
332 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  38.62 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  39 
 
 
292 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  38.06 
 
 
299 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  38.41 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  38.41 
 
 
299 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  37.2 
 
 
299 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  36.84 
 
 
300 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  36.77 
 
 
300 aa  175  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  36.27 
 
 
300 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  36.68 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  35.93 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  35.4 
 
 
294 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  33.91 
 
 
417 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  36.92 
 
 
292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  37.88 
 
 
298 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  37.71 
 
 
323 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  33.1 
 
 
292 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  34.11 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  33.9 
 
 
292 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  36.46 
 
 
308 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  38 
 
 
311 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  38.06 
 
 
326 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  32.98 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  34.38 
 
 
318 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.76 
 
 
285 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3019  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 
293 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.798249  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3862  transglutaminase domain protein  32.29 
 
 
335 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  33.67 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  33.68 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  36.84 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2612  transglutaminase domain-containing protein  33.89 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  37.2 
 
 
279 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  37.2 
 
 
279 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  37.2 
 
 
279 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  36.52 
 
 
281 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  35.17 
 
 
279 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0952  transglutaminase-like protein  33.33 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  36.21 
 
 
279 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  34.25 
 
 
279 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  34.48 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  31.94 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  36.11 
 
 
280 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  31.6 
 
 
272 aa  132  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  35.15 
 
 
292 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>